More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3092 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  92.36 
 
 		 471 aa  870    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  91.72 
 
 		 471 aa  868    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  70 
 
 		 470 aa  674    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 471 aa  957    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  72.82 
 
 		 471 aa  673    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  75.49 
 
 		 466 aa  725    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  71.27 
 
 		 468 aa  679    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  57.96 
 
 		 475 aa  542  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  58.03 
 
 		 474 aa  539  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 		 473 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  57.05 
 
 		 473 aa  534  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  57.54 
 
 		 473 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 473 aa  528  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  55.81 
 
 		 496 aa  529  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 491 aa  527  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 490 aa  527  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  57.54 
 
 		 474 aa  521  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 474 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  56.2 
 
 		 471 aa  521  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  58.26 
 
 		 474 aa  514  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  58.05 
 
 		 474 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 		 475 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 473 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 		 474 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 		 474 aa  511  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 473 aa  508  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 473 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 		 490 aa  502  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 		 476 aa  499  1e-140  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 468 aa  491  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  55.18 
 
 		 473 aa  486  1e-136  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 487 aa  477  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 474 aa  458  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 466 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 473 aa  427  1e-118  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 466 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 469 aa  396  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 504 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 469 aa  392  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 504 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 512 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 504 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 466 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 469 aa  385  1e-105  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 469 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 472 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 465 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 469 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 470 aa  368  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 		 469 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 464 aa  368  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 469 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 467 aa  364  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 471 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 471 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 467 aa  363  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 469 aa  363  3e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 471 aa  363  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 472 aa  363  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 463 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 471 aa  363  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 469 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 467 aa  362  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 471 aa  362  9e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 471 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 471 aa  362  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 471 aa  361  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 471 aa  362  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 467 aa  362  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 471 aa  362  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  40.48 
 
 		 471 aa  362  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 463 aa  362  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 459 aa  361  2e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 471 aa  360  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 469 aa  361  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 470 aa  361  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 475 aa  361  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1642  glutamyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 469 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000802053  normal  0.126608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 469 aa  360  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 469 aa  360  4e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>