More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3180 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  65.46 
 
 		 473 aa  639    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 490 aa  1003    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  65.03 
 
 		 473 aa  634  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  65.53 
 
 		 474 aa  632  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  63.54 
 
 		 473 aa  628  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  63.91 
 
 		 475 aa  628  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  64.89 
 
 		 474 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  65.46 
 
 		 471 aa  624  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  63.83 
 
 		 474 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  65.18 
 
 		 475 aa  615  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  62.42 
 
 		 473 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  64.74 
 
 		 473 aa  613  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  64.24 
 
 		 474 aa  610  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  62.55 
 
 		 491 aa  611  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  63.75 
 
 		 474 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  61.9 
 
 		 496 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  64.03 
 
 		 474 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  62.26 
 
 		 474 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  63.81 
 
 		 474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  64.94 
 
 		 468 aa  601  1e-170  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  59.19 
 
 		 476 aa  595  1e-169  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  62 
 
 		 473 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  62.1 
 
 		 474 aa  588  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  61.36 
 
 		 473 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  62.82 
 
 		 473 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  58.7 
 
 		 466 aa  564  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  56.52 
 
 		 466 aa  533  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  56.72 
 
 		 487 aa  533  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  57.7 
 
 		 490 aa  524  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  55.67 
 
 		 471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 471 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 471 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  53.73 
 
 		 468 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 479 aa  501  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  54.43 
 
 		 466 aa  500  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  53.66 
 
 		 474 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  53 
 
 		 471 aa  475  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 470 aa  465  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 473 aa  459  9.999999999999999e-129  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 465 aa  455  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  51.52 
 
 		 470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 468 aa  438  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 466 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 469 aa  438  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  49.35 
 
 		 466 aa  437  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 467 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  49.34 
 
 		 467 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  48.38 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  50.65 
 
 		 471 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 		 472 aa  430  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 469 aa  431  1e-119  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 470 aa  425  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 469 aa  425  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0111  glutamyl-tRNA synthetase  46.87 
 
 		 462 aa  423  1e-117  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 468 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 469 aa  421  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 512 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 460 aa  420  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 472 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 463 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 467 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 471 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 471 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  45.43 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 		 471 aa  413  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 470 aa  414  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 504 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 459 aa  415  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 464 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 459 aa  414  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 469 aa  413  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 471 aa  413  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 469 aa  411  1e-113  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 470 aa  412  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 		 470 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2140  glutamyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000804672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 		 471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 473 aa  406  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>