More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0600 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  75.48 
 
 
473 aa  745    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
476 aa  981    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  75.91 
 
 
473 aa  750    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  74.41 
 
 
473 aa  735    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  63.46 
 
 
471 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  67.45 
 
 
475 aa  678    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  63.68 
 
 
474 aa  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  63.17 
 
 
473 aa  636    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  63.46 
 
 
474 aa  631  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  62.77 
 
 
475 aa  627  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  62.82 
 
 
474 aa  628  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  62.61 
 
 
474 aa  622  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  63.03 
 
 
491 aa  621  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  62.61 
 
 
474 aa  622  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  62.39 
 
 
474 aa  620  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  61.88 
 
 
473 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  61.7 
 
 
496 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  62.66 
 
 
473 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  60.93 
 
 
474 aa  608  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  61.28 
 
 
474 aa  605  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  59.19 
 
 
490 aa  595  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  62.1 
 
 
473 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  61.24 
 
 
473 aa  589  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 
474 aa  551  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  55.79 
 
 
468 aa  533  1e-150  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 
487 aa  532  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 
466 aa  517  1.0000000000000001e-145  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  53.96 
 
 
466 aa  505  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 
490 aa  494  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
468 aa  494  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  51.39 
 
 
471 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 
471 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
471 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
466 aa  483  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
470 aa  480  1e-134  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
479 aa  480  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  51.61 
 
 
471 aa  449  1e-125  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 
473 aa  437  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 
468 aa  434  1e-120  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 
465 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
469 aa  416  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  45.22 
 
 
469 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 
470 aa  415  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
466 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
471 aa  411  1e-113  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
466 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
470 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 
472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
466 aa  405  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 
463 aa  403  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 
470 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
470 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
469 aa  404  1e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  43.84 
 
 
466 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  45.92 
 
 
463 aa  403  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 
459 aa  403  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 
463 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
472 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
479 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
463 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
467 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
467 aa  397  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  45 
 
 
459 aa  395  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
472 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
469 aa  392  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
460 aa  392  1e-108  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1293  glutamyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
463 aa  391  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
466 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
465 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0111  glutamyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
462 aa  390  1e-107  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
468 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
467 aa  392  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
468 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
472 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 
490 aa  385  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
469 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
467 aa  385  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  45.17 
 
 
467 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
470 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
509 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
475 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
464 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
467 aa  381  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
464 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
491 aa  375  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04820  glutamyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 
467 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1209  glutamyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
467 aa  378  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0142351 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
462 aa  376  1e-103  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
469 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
475 aa  378  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2028  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
467 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
469 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
469 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
469 aa  372  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
471 aa  372  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  43.68 
 
 
473 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
469 aa  374  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
469 aa  373  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 
473 aa  375  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>