More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1601 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 468 aa  949    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  64.94 
 
 		 490 aa  620  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  65.87 
 
 		 474 aa  607  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  63.89 
 
 		 475 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  63.09 
 
 		 473 aa  594  1e-168  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  62.66 
 
 		 473 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  62.66 
 
 		 473 aa  588  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  64.88 
 
 		 471 aa  587  1e-166  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 474 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  63.25 
 
 		 474 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  63.52 
 
 		 473 aa  582  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  63.38 
 
 		 475 aa  581  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  62.23 
 
 		 473 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  62.98 
 
 		 474 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  62.55 
 
 		 474 aa  574  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  62.61 
 
 		 474 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  62.55 
 
 		 474 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  62.47 
 
 		 490 aa  559  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 474 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 491 aa  557  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  59.87 
 
 		 466 aa  558  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 474 aa  551  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  62.47 
 
 		 473 aa  554  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  58.64 
 
 		 496 aa  549  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  59.74 
 
 		 487 aa  550  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  55.79 
 
 		 476 aa  546  1e-154  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  61.24 
 
 		 473 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 		 473 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  58.79 
 
 		 466 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 		 466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  56.37 
 
 		 479 aa  509  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  56.93 
 
 		 468 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 470 aa  499  1e-140  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 471 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 		 471 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  56.77 
 
 		 471 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  56.34 
 
 		 471 aa  481  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 467 aa  457  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 		 474 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 468 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 465 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 466 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 466 aa  443  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 471 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  46.96 
 
 		 473 aa  441  9.999999999999999e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  50.11 
 
 		 467 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  48.15 
 
 		 470 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 467 aa  438  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 469 aa  438  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 469 aa  433  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 470 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 472 aa  433  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  48.58 
 
 		 472 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 463 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  48.48 
 
 		 468 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 466 aa  423  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 466 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  45.69 
 
 		 469 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  48.61 
 
 		 467 aa  412  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 464 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 472 aa  411  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 500 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 468 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 472 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2140  glutamyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000804672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 479 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 470 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  44.18 
 
 		 470 aa  403  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 469 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 469 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1022  glutamyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000173341  normal  0.120232 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 504 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 464 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 504 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 469 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  45.39 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 469 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 469 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  47.73 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0242  glutamyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 459 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 469 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 		 471 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>