More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0605 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  83.55 
 
 
469 aa  803    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
469 aa  958    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  52.42 
 
 
473 aa  516  1.0000000000000001e-145  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
468 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  43.97 
 
 
474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
490 aa  443  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
473 aa  445  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
475 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
473 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
490 aa  441  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
473 aa  438  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
474 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
474 aa  432  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
474 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
474 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
474 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
473 aa  430  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
473 aa  426  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
474 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
476 aa  426  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
475 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
468 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
474 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
474 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
471 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
466 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
473 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  42.34 
 
 
496 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
491 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
471 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
471 aa  402  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
487 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
466 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 
471 aa  398  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
473 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 
473 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 
466 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
470 aa  391  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
474 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
479 aa  379  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
465 aa  366  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 
466 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
465 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
468 aa  355  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
470 aa  353  4e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
470 aa  352  5.9999999999999994e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
464 aa  352  8e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
470 aa  352  1e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 
466 aa  350  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
470 aa  350  3e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
467 aa  350  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
469 aa  349  5e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
463 aa  348  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 
467 aa  346  4e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
468 aa  346  5e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 
467 aa  345  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
469 aa  345  1e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
509 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  37.69 
 
 
467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
473 aa  343  4e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1114  glutamyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 
465 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00321012  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
466 aa  340  5e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
472 aa  339  5e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
474 aa  339  5.9999999999999996e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
470 aa  339  7e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
468 aa  339  7e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
472 aa  338  9e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
512 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1022  glutamyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
465 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000173341  normal  0.120232 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
464 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
500 aa  335  9e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
463 aa  335  1e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1209  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 
467 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0142351 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
469 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
475 aa  333  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
472 aa  333  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 
475 aa  333  6e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 
470 aa  332  6e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
473 aa  332  9e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
469 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
469 aa  331  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
504 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
504 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
469 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04820  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
467 aa  331  2e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
504 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
471 aa  331  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
469 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
469 aa  331  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
469 aa  330  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
469 aa  330  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
466 aa  330  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 
466 aa  330  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  37.44 
 
 
469 aa  330  4e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
469 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
469 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
469 aa  329  7e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 
467 aa  329  7e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
469 aa  329  7e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>