More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2031 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 487 aa  983    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  69.41 
 
 		 474 aa  654    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  64.68 
 
 		 490 aa  594  1e-169  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  61.6 
 
 		 473 aa  551  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  61.31 
 
 		 473 aa  549  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  61.18 
 
 		 473 aa  545  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  59.21 
 
 		 475 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 475 aa  539  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  58.28 
 
 		 473 aa  536  1e-151  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  56.72 
 
 		 490 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  56.66 
 
 		 476 aa  532  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  59.74 
 
 		 468 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  58.11 
 
 		 473 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 474 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 471 aa  524  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 491 aa  522  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  58.02 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  57.17 
 
 		 474 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  57.47 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  57.35 
 
 		 496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 474 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  56.18 
 
 		 474 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  56.21 
 
 		 474 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 474 aa  510  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 		 473 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  57.44 
 
 		 473 aa  503  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  57.05 
 
 		 473 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 		 466 aa  494  9.999999999999999e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  54.97 
 
 		 466 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 471 aa  473  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 470 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 479 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 468 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  52.68 
 
 		 466 aa  461  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  52.23 
 
 		 474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 471 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  48.3 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 465 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 466 aa  414  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 		 472 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 480 aa  401  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 470 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 467 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 467 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  45.96 
 
 		 471 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 470 aa  395  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 467 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 469 aa  392  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1321  glutamyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 464 aa  388  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246268  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  45.84 
 
 		 512 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 474 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 471 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  45.8 
 
 		 474 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 470 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 472 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 474 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  44.87 
 
 		 473 aa  380  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 470 aa  378  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 466 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 466 aa  375  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 471 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 472 aa  376  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 		 469 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  43.95 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>