More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3213 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 474 aa  949    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  69.41 
 
 		 487 aa  654    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  73.43 
 
 		 490 aa  652    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  63.98 
 
 		 473 aa  599  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  63.56 
 
 		 473 aa  593  1e-168  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  63.56 
 
 		 473 aa  592  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  65.11 
 
 		 474 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  62.1 
 
 		 490 aa  588  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  65.87 
 
 		 468 aa  587  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  64.47 
 
 		 474 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  63.4 
 
 		 473 aa  584  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  62.26 
 
 		 491 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  64.04 
 
 		 474 aa  581  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  64.12 
 
 		 475 aa  580  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  62.98 
 
 		 474 aa  581  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  62.71 
 
 		 473 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  61.55 
 
 		 496 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  63.06 
 
 		 475 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  64.32 
 
 		 473 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  62.61 
 
 		 474 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  63.4 
 
 		 474 aa  570  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  63.54 
 
 		 474 aa  565  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  63.11 
 
 		 474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  63 
 
 		 471 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 473 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  62.29 
 
 		 473 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 		 476 aa  551  1e-155  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  59.87 
 
 		 466 aa  541  9.999999999999999e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 		 466 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  57.54 
 
 		 471 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  58.58 
 
 		 466 aa  509  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  57.11 
 
 		 471 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 		 468 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 471 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  55.82 
 
 		 470 aa  505  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  54.27 
 
 		 479 aa  485  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  55.84 
 
 		 471 aa  472  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  54.74 
 
 		 474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  52.26 
 
 		 465 aa  457  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 473 aa  437  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 469 aa  435  1e-121  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  48.91 
 
 		 466 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 469 aa  428  1e-118  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 468 aa  425  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 471 aa  423  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 		 470 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 466 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  48.2 
 
 		 512 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  47.21 
 
 		 469 aa  420  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 470 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 473 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 469 aa  415  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 472 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  48.4 
 
 		 469 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1321  glutamyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246268  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2140  glutamyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 		 465 aa  413  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000804672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  48.17 
 
 		 467 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 504 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  48.03 
 
 		 465 aa  408  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  47.66 
 
 		 504 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  47.93 
 
 		 467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  46.32 
 
 		 470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  46.53 
 
 		 470 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1220  glutamyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000664891  normal  0.415477 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 469 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  47.12 
 
 		 469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  46.07 
 
 		 468 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 468 aa  403  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 472 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 467 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  46.67 
 
 		 469 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 480 aa  404  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 469 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 500 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1114  glutamyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00321012  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 471 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 469 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 471 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 471 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 471 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>