More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1640 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 466 aa  939    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  64.87 
 
 		 466 aa  598  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  58.7 
 
 		 490 aa  564  1.0000000000000001e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  59.1 
 
 		 475 aa  557  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  58.55 
 
 		 473 aa  548  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 		 473 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  58.12 
 
 		 473 aa  543  1e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 474 aa  541  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  59.87 
 
 		 474 aa  541  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  59.87 
 
 		 468 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 474 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 		 491 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  58.41 
 
 		 474 aa  538  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 474 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 471 aa  531  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  57.39 
 
 		 496 aa  530  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 474 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  56.53 
 
 		 473 aa  528  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  57.87 
 
 		 474 aa  525  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  58.3 
 
 		 474 aa  527  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 		 475 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 473 aa  521  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 		 473 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 		 476 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  56.03 
 
 		 473 aa  511  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  56.28 
 
 		 473 aa  495  1e-139  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 		 487 aa  494  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 479 aa  472  1e-132  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  54.53 
 
 		 490 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 		 466 aa  451  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 		 474 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 465 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 471 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 471 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  48.6 
 
 		 470 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 		 472 aa  431  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  47.61 
 
 		 466 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 471 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 466 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  48.07 
 
 		 472 aa  418  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 465 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 467 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 470 aa  415  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 469 aa  418  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 466 aa  414  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  47.65 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 467 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 469 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 470 aa  404  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 470 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 472 aa  403  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 470 aa  405  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  43.19 
 
 		 473 aa  400  9.999999999999999e-111  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 		 467 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 470 aa  401  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 473 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 472 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 467 aa  395  1e-109  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 		 469 aa  398  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 469 aa  398  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 480 aa  395  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 471 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 471 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 		 464 aa  393  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 471 aa  392  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  44.59 
 
 		 472 aa  389  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 471 aa  392  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  44.16 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 509 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 471 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 475 aa  386  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  44.09 
 
 		 475 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1321  glutamyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 464 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246268  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 		 504 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  45.81 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 		 469 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  42.76 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2028  glutamyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>