More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5223 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  80.6 
 
 		 474 aa  762    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  95.78 
 
 		 474 aa  909    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  72.61 
 
 		 471 aa  674    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  68.71 
 
 		 473 aa  665    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  70.34 
 
 		 473 aa  677    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  96.2 
 
 		 474 aa  913    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  70.76 
 
 		 473 aa  682    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  71.76 
 
 		 473 aa  682    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  68.79 
 
 		 496 aa  662    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  71.79 
 
 		 473 aa  686    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  81.66 
 
 		 474 aa  768    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  70.4 
 
 		 473 aa  656    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  69.85 
 
 		 474 aa  673    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  69.98 
 
 		 473 aa  651    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  70.7 
 
 		 491 aa  676    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4501  glutamyl-tRNA synthetase  71.76 
 
 		 474 aa  675    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  72.09 
 
 		 473 aa  672    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  67.09 
 
 		 475 aa  639    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  82.09 
 
 		 474 aa  769    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  84.29 
 
 		 475 aa  803    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 474 aa  945    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  62.39 
 
 		 476 aa  620  1e-176  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  63.75 
 
 		 490 aa  606  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  63.4 
 
 		 474 aa  570  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  62.98 
 
 		 468 aa  565  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1640  glutamyl-tRNA synthetase  59.7 
 
 		 466 aa  541  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.416955 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1133  glutamyl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 466 aa  519  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.484042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0705  glutamyl-tRNA synthetase  57.93 
 
 		 471 aa  513  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3717  glutamyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0517014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1995  glutamyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 471 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.249393  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  55.74 
 
 		 487 aa  510  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  57.51 
 
 		 471 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1396  glutamyl-tRNA synthetase  55.08 
 
 		 479 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00644149 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0830  glutamyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 490 aa  490  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404768  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1842  glutamyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 		 470 aa  485  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378644 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  55.6 
 
 		 471 aa  467  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2786  glutamyl-tRNA synthetase  53.07 
 
 		 474 aa  464  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596064  normal  0.0148093 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 465 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 470 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0435  glutamyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 473 aa  445  1.0000000000000001e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 		 466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 472 aa  442  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 472 aa  440  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  48.51 
 
 		 470 aa  436  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 		 467 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 469 aa  432  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 		 471 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  48.31 
 
 		 466 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 463 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 469 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 475 aa  418  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 468 aa  418  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 		 469 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 467 aa  419  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0605  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 469 aa  420  1e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  48.21 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 471 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 471 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 468 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 		 471 aa  412  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  47.03 
 
 		 470 aa  413  1e-114  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 475 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0145  glutamyl-tRNA synthetase  48.09 
 
 		 462 aa  413  1e-114  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.092829  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  46.47 
 
 		 509 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 		 472 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 466 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 470 aa  406  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0111  glutamyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 504 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 		 504 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 466 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  46.44 
 
 		 512 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  45.93 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 467 aa  403  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 469 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  46.81 
 
 		 473 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  44.07 
 
 		 480 aa  403  1e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 469 aa  403  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0432  glutamyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 469 aa  399  9.999999999999999e-111  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 464 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 467 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 460 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>