More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_18780 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
491 aa  1013    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 
479 aa  588  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  54.51 
 
 
490 aa  584  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  53.56 
 
 
501 aa  568  1e-160  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 
494 aa  552  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 
480 aa  546  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  52.07 
 
 
495 aa  537  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  51.22 
 
 
495 aa  504  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
477 aa  481  1e-134  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 
485 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
490 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 
485 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
488 aa  467  9.999999999999999e-131  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
482 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 
496 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
488 aa  451  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
478 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
465 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
467 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
484 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
466 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
467 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
467 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 
504 aa  419  1e-116  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
485 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
486 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
487 aa  419  1e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  43.81 
 
 
500 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
468 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
469 aa  414  1e-114  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
469 aa  412  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
490 aa  411  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
484 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
470 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
466 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 
463 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
492 aa  405  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
468 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
491 aa  397  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
464 aa  398  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
464 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
474 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
462 aa  397  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
481 aa  398  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  41 
 
 
488 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
474 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 
488 aa  393  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
469 aa  395  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
466 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
507 aa  393  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
471 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  43.34 
 
 
464 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
492 aa  392  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 
498 aa  392  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
480 aa  392  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
474 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
469 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
485 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
485 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
485 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
485 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
485 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  43.87 
 
 
464 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
485 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
469 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
485 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
491 aa  386  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
485 aa  387  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
473 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
491 aa  388  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
467 aa  386  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
471 aa  388  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
473 aa  388  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
473 aa  386  1e-106  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
469 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
471 aa  385  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
469 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
470 aa  383  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
480 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
469 aa  385  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
506 aa  382  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
469 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
463 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
473 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
467 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
503 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
466 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
469 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
504 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
484 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
492 aa  382  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
535 aa  382  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
469 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
463 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
491 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
470 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>