More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3336 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 491 aa  1003    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  63.14 
 
 		 509 aa  623  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  62.53 
 
 		 493 aa  609  1e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  60.77 
 
 		 494 aa  602  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  62.55 
 
 		 494 aa  594  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 		 509 aa  587  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  58.99 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  60.61 
 
 		 496 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 		 490 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 		 490 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 		 490 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  61.2 
 
 		 491 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  62.16 
 
 		 499 aa  578  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  59.55 
 
 		 504 aa  581  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1202  glutamyl-tRNA synthetase  59.6 
 
 		 503 aa  580  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  60.79 
 
 		 501 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 		 495 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  58.66 
 
 		 501 aa  567  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 		 504 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 504 aa  562  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  55.49 
 
 		 492 aa  559  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0201  glutamate--tRNA ligase  55.42 
 
 		 517 aa  548  1e-155  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1261  glutamyl-tRNA synthetase  56.73 
 
 		 506 aa  549  1e-155  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  58.76 
 
 		 490 aa  542  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 		 512 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08640  glutamyl-tRNA synthetase  56.96 
 
 		 525 aa  527  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 532 aa  523  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 		 504 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 490 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 485 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 494 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 482 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 491 aa  368  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 485 aa  360  2e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 484 aa  359  7e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 477 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 492 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 498 aa  355  1e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 492 aa  354  2e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 		 503 aa  351  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 486 aa  351  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 501 aa  352  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 488 aa  350  4e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 478 aa  349  5e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 487 aa  349  7e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 496 aa  348  9e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 484 aa  345  7e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.11 
 
 		 495 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 479 aa  342  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 		 535 aa  339  7e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 507 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 		 480 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 506 aa  337  3.9999999999999995e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 455 aa  336  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 455 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 490 aa  336  7e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 469 aa  334  2e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 490 aa  333  3e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 488 aa  333  3e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 491 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 469 aa  333  4e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 485 aa  333  5e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 504 aa  332  8e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 506 aa  332  9e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 467 aa  329  7e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 491 aa  329  8e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 495 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 463 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 485 aa  326  5e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 509 aa  326  5e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 491 aa  326  6e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 469 aa  326  7e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 509 aa  326  7e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 491 aa  325  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 500 aa  325  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 468 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 481 aa  324  2e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 485 aa  324  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 469 aa  323  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 485 aa  323  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2647  glutamyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 		 463 aa  320  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 		 499 aa  320  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 467 aa  320  5e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 505 aa  320  5e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 466 aa  320  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 466 aa  320  5e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 464 aa  319  7e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 471 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 468 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 489 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 488 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>