More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1273 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
477 aa  977    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 
479 aa  531  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
490 aa  513  1e-144  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  50.73 
 
 
494 aa  500  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
482 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  52.09 
 
 
485 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  47.74 
 
 
495 aa  482  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 
485 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 
501 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 
491 aa  467  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
486 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 
485 aa  464  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
478 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
488 aa  456  1e-127  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
465 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 
467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 
480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 
466 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
480 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
495 aa  443  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
468 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
491 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
492 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
469 aa  433  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
490 aa  433  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
488 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
469 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
488 aa  430  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
469 aa  429  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
467 aa  430  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
487 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 
463 aa  431  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 
467 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
496 aa  428  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
473 aa  427  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 
484 aa  424  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
490 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
464 aa  419  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  45.64 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
481 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
484 aa  416  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
485 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
466 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  43.7 
 
 
469 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
467 aa  408  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 
466 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
491 aa  409  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 
463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
464 aa  407  1.0000000000000001e-112  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
506 aa  402  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
485 aa  404  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
485 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
485 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
485 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
485 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
485 aa  404  1e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  43.54 
 
 
474 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
470 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 
471 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
467 aa  402  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
484 aa  401  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 
491 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
471 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 
472 aa  401  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 
483 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  42 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
468 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
471 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
464 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 
500 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 
491 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
484 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
471 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
471 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
485 aa  395  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  43.9 
 
 
464 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  42.16 
 
 
464 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 
475 aa  398  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
480 aa  397  1e-109  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
471 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
471 aa  397  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
484 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
471 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
471 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
471 aa  398  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
471 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
471 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
471 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
473 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
465 aa  392  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
473 aa  392  1e-108  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  42.92 
 
 
471 aa  392  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
483 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  42.32 
 
 
471 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
471 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
469 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
471 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>