More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2357 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
490 aa  1006    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 
482 aa  530  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
488 aa  518  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 
485 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  52.16 
 
 
485 aa  508  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
488 aa  463  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 
485 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 
486 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  47.23 
 
 
491 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 
494 aa  444  1e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
477 aa  433  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
478 aa  432  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
479 aa  425  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
501 aa  427  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
481 aa  422  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  44.7 
 
 
484 aa  415  9.999999999999999e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
491 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
469 aa  413  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 
490 aa  414  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 
480 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  44.33 
 
 
495 aa  415  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
484 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 
469 aa  410  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
484 aa  409  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
485 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
485 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
485 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
485 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
485 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
490 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
485 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  45.38 
 
 
491 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 
491 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
491 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
464 aa  402  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
494 aa  399  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
485 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  41.93 
 
 
546 aa  396  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 
473 aa  392  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
488 aa  382  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
482 aa  382  1e-105  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 
469 aa  385  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
488 aa  376  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
465 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  40.61 
 
 
518 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
466 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
483 aa  368  1e-100  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
495 aa  365  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
467 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
469 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
504 aa  365  1e-99  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
465 aa  364  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
498 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 
468 aa  362  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 
492 aa  361  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 
492 aa  360  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
483 aa  359  5e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 
466 aa  358  9e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
469 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
500 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
470 aa  355  6.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
499 aa  355  7.999999999999999e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1667  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
465 aa  355  1e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.194864  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0531  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
465 aa  355  1e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0244203  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
484 aa  354  2e-96  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 
535 aa  354  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
492 aa  355  2e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
484 aa  354  2.9999999999999997e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
466 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
469 aa  353  5e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
471 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
464 aa  352  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
471 aa  352  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
469 aa  350  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 
467 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
493 aa  350  4e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
473 aa  349  5e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
467 aa  349  6e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  39.28 
 
 
588 aa  348  1e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
483 aa  347  3e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
469 aa  346  6e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
467 aa  346  6e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
469 aa  346  7e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
466 aa  345  8e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
481 aa  345  8.999999999999999e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
469 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
469 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
469 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 
483 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
501 aa  345  1e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
469 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
484 aa  344  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
472 aa  345  2e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
466 aa  344  2e-93  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>