More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1201 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 501 aa  1040    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 499 aa  474  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0321  glutamyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 498 aa  459  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  49.31 
 
 		 484 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0161  glutamyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 498 aa  443  1e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361508  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 484 aa  441  9.999999999999999e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 484 aa  433  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 486 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 491 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 484 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 484 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 483 aa  429  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 485 aa  425  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 491 aa  426  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  46.02 
 
 		 491 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  47.31 
 
 		 491 aa  426  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  47.29 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  46.71 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 464 aa  386  1e-106  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 		 488 aa  379  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 477 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 485 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 488 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 485 aa  361  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 482 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 490 aa  356  5e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 490 aa  355  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 478 aa  349  7e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 488 aa  348  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 501 aa  346  5e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 490 aa  345  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 482 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 483 aa  337  2.9999999999999997e-91  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 469 aa  336  7e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 493 aa  334  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 494 aa  334  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 491 aa  333  5e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  38.14 
 
 		 546 aa  332  8e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 481 aa  331  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 479 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.2 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 492 aa  324  2e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 487 aa  324  2e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 504 aa  322  9.000000000000001e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 481 aa  321  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 500 aa  320  3e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 		 496 aa  319  7.999999999999999e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 467 aa  317  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 		 881 aa  317  3e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 481 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 484 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 484 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 480 aa  311  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 469 aa  311  2e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 482 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 		 481 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  36.18 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  46.84 
 
 		 483 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 481 aa  304  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 		 495 aa  303  5.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 		 483 aa  303  6.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 464 aa  300  4e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  37.4 
 
 		 518 aa  300  4e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0894  glutamyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 		 468 aa  299  6e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.101678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0548  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 459 aa  300  6e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.102119  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  36 
 
 		 463 aa  299  8e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  36.75 
 
 		 493 aa  299  9e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  35.19 
 
 		 466 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 477 aa  298  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  34.49 
 
 		 588 aa  298  2e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2196  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 463 aa  296  4e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000179412  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 465 aa  297  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3757  glutamyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 		 462 aa  296  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00456424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 467 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 488 aa  296  6e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  35.47 
 
 		 506 aa  295  1e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 		 490 aa  295  1e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 		 503 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04981  glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 476 aa  295  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.475242  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1562  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 460 aa  295  1e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000571227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 463 aa  294  2e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 463 aa  295  2e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 477 aa  295  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 467 aa  294  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0473  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 479 aa  294  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138189  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 492 aa  293  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  35.4 
 
 		 512 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 465 aa  293  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0704  glutamyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 		 482 aa  293  5e-78  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.574846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>