More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0051 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  100 
 
 
518 aa  1065    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
482 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
478 aa  432  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  43.17 
 
 
488 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
485 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  40.4 
 
 
485 aa  412  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 
485 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
469 aa  411  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
469 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
495 aa  395  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
477 aa  399  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
490 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
479 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
490 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
486 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
481 aa  387  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
488 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  42.48 
 
 
495 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
480 aa  385  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
490 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
494 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
501 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
496 aa  379  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  41 
 
 
491 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
498 aa  378  1e-103  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
464 aa  379  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
469 aa  379  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
535 aa  372  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
491 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
473 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
485 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
485 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
485 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  42 
 
 
504 aa  369  1e-101  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
485 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
492 aa  369  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
480 aa  370  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
485 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
466 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
485 aa  369  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
466 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
485 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 
469 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
491 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 
465 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
491 aa  361  2e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
494 aa  360  4e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  39.64 
 
 
546 aa  359  6e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
492 aa  359  7e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
488 aa  359  7e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
467 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
471 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
485 aa  353  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
466 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
484 aa  352  7e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
484 aa  351  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
484 aa  351  2e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 
491 aa  350  5e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
467 aa  345  8e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  35.9 
 
 
466 aa  344  2e-93  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
474 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
488 aa  343  2.9999999999999997e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 
467 aa  343  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
474 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
468 aa  341  2e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
493 aa  339  7e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
499 aa  339  8e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 
484 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
506 aa  338  1.9999999999999998e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
470 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
470 aa  336  5e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
481 aa  337  5e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
487 aa  336  7e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
465 aa  334  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
483 aa  333  3e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 
464 aa  332  1e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 
482 aa  331  2e-89  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
481 aa  331  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
469 aa  331  2e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
464 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
464 aa  331  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  37.57 
 
 
588 aa  331  2e-89  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
473 aa  330  3e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
484 aa  330  3e-89  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 
471 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 
482 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 
471 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 
500 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
484 aa  329  8e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 
471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  34.6 
 
 
504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
471 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 
472 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 
469 aa  327  3e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
471 aa  327  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
483 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 
470 aa  326  5e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
463 aa  326  7e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
474 aa  325  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>