More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1432 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  99.79 
 
 
469 aa  943    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
469 aa  946    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  64.95 
 
 
469 aa  634  1e-180  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  62.47 
 
 
473 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 
488 aa  566  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  48.66 
 
 
494 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  47.3 
 
 
485 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
485 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  46 
 
 
482 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
477 aa  433  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  48.85 
 
 
478 aa  430  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
488 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
501 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 
480 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
490 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 
490 aa  413  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 
479 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
488 aa  409  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
464 aa  411  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
490 aa  408  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 
464 aa  411  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
491 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
481 aa  396  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  44.49 
 
 
518 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 
496 aa  391  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
492 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  43.51 
 
 
495 aa  386  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
488 aa  384  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 
465 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
491 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
504 aa  384  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
485 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
485 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
485 aa  379  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
485 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
491 aa  381  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
485 aa  382  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 
491 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
485 aa  379  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
485 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
486 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
500 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
491 aa  377  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 
495 aa  374  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
465 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
468 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
484 aa  369  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
471 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
464 aa  371  1e-101  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
467 aa  369  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
467 aa  368  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
485 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 
466 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
467 aa  365  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
498 aa  366  1e-100  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
487 aa  363  2e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
484 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
484 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
484 aa  363  3e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
466 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
474 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
499 aa  363  5.0000000000000005e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
469 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
474 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
467 aa  362  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
466 aa  362  8e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
462 aa  359  6e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
467 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
472 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  42.16 
 
 
546 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
474 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
484 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
493 aa  355  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2088  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000151116  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
480 aa  353  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
481 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 
495 aa  350  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
500 aa  351  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5365  glutamyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
512 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000051324  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
471 aa  350  4e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
483 aa  350  4e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1642  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
469 aa  348  9e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000000000802053  normal  0.126608 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1984  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
469 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000434285  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6021  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
469 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000513528  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 
469 aa  347  2e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1022  glutamyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 
465 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000173341  normal  0.120232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1114  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 
465 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00321012  normal  0.762365 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
469 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
469 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 
470 aa  347  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
469 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
469 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
467 aa  346  4e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2056  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
469 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000244557  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2075  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
469 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467012  normal  0.81702 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 
504 aa  346  5e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2495  glutamyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 
469 aa  346  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000536822  hitchhiker  0.00468963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1377  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
469 aa  346  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000079335  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1958  glutamyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 
469 aa  345  8e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846631  normal  0.452731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>