More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0191 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  67.22 
 
 
485 aa  705    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
482 aa  998    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 
485 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 
488 aa  578  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  53.01 
 
 
490 aa  530  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 
488 aa  525  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 
486 aa  518  1e-146  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  51.13 
 
 
494 aa  521  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  50.83 
 
 
491 aa  511  1e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  51.56 
 
 
485 aa  508  9.999999999999999e-143  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 
490 aa  507  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  49.06 
 
 
485 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
491 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
477 aa  495  1e-139  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 
479 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
490 aa  485  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
485 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
485 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
485 aa  484  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
485 aa  484  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
485 aa  483  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
485 aa  484  1e-135  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
491 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
491 aa  484  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
485 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  45.23 
 
 
501 aa  476  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
484 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
484 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 
484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  47.71 
 
 
478 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  45.42 
 
 
495 aa  463  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 
481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
491 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
495 aa  438  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 
469 aa  435  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
469 aa  437  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  44.54 
 
 
546 aa  429  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 
481 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
488 aa  424  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
499 aa  424  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 
492 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
469 aa  421  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  43.94 
 
 
518 aa  418  1e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  42.29 
 
 
480 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  45.67 
 
 
483 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 
500 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
468 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  43.62 
 
 
493 aa  412  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
466 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 
484 aa  412  1e-114  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 
473 aa  410  1e-113  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
481 aa  408  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 
494 aa  411  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
467 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
498 aa  409  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
466 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  45.03 
 
 
483 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 
468 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
504 aa  402  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
481 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
467 aa  405  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
492 aa  403  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 
881 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
483 aa  405  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
484 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 
484 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
466 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
482 aa  400  9.999999999999999e-111  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
481 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  42 
 
 
496 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
467 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
482 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
464 aa  396  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
467 aa  397  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
480 aa  395  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
471 aa  395  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
492 aa  396  1e-109  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 
467 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
504 aa  396  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
470 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
488 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
464 aa  394  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
464 aa  393  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
471 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
471 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
471 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
484 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
535 aa  389  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 
471 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 
504 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
466 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
471 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
471 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
465 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
487 aa  388  1e-106  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
471 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
466 aa  385  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
471 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>