More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2393 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  67.98 
 
 
481 aa  662    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  65.07 
 
 
483 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
481 aa  980    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  64.66 
 
 
483 aa  641    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  64.3 
 
 
881 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  64.86 
 
 
481 aa  640    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  63.05 
 
 
481 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  68.94 
 
 
482 aa  661    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  63.94 
 
 
477 aa  615  1e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06791  glutamyl-tRNA synthetase  63.88 
 
 
476 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 
477 aa  588  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 
492 aa  580  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  57.2 
 
 
476 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05291  glutamyl-tRNA synthetase  56.58 
 
 
492 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0717874 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
493 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04981  glutamyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
476 aa  492  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.475242  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05281  glutamyl-tRNA synthetase  49.27 
 
 
476 aa  491  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0473  glutamyl-tRNA synthetase  48.14 
 
 
479 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.138189  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
482 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
485 aa  393  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 
491 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 
477 aa  368  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
485 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
490 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 
485 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
472 aa  363  3e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
488 aa  359  6e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
486 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
485 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
491 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
466 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 
471 aa  356  5.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
470 aa  356  6.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
467 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
471 aa  355  8.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
471 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
466 aa  353  5e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  42.64 
 
 
465 aa  352  7e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 
480 aa  352  7e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
467 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
485 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
485 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
485 aa  352  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
485 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
485 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
491 aa  352  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
485 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
468 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 
470 aa  351  2e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
491 aa  350  3e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
488 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
471 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
471 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
467 aa  350  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
481 aa  350  4e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 
485 aa  349  6e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
471 aa  349  7e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
509 aa  349  8e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 
475 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 
488 aa  347  3e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
471 aa  347  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 
469 aa  347  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  42.26 
 
 
472 aa  346  6e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
466 aa  346  7e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 
466 aa  346  7e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
484 aa  345  1e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
468 aa  345  1e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 
470 aa  345  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
466 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 
467 aa  344  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
475 aa  343  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
464 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
467 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
470 aa  342  8e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
469 aa  342  8e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
494 aa  342  9e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
479 aa  341  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
484 aa  341  2e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
469 aa  340  4e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
469 aa  340  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
469 aa  339  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
483 aa  339  8e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
468 aa  339  8e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 
469 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 
469 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
471 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  39.96 
 
 
471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
471 aa  336  5e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
471 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
471 aa  335  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4767  glutamyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
468 aa  335  9e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
471 aa  335  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>