More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0168 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
488 aa  1007    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 
482 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 
490 aa  531  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
485 aa  511  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 
485 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
488 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
484 aa  503  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 
485 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 
486 aa  500  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
484 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
484 aa  500  1e-140  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
491 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  49.38 
 
 
485 aa  488  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
491 aa  491  1e-137  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
491 aa  484  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
491 aa  481  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
485 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
485 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
485 aa  480  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
485 aa  480  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
485 aa  480  1e-134  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 
485 aa  478  1e-133  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
485 aa  478  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  45.47 
 
 
490 aa  474  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  48.67 
 
 
490 aa  474  1e-132  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  48.88 
 
 
499 aa  461  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 
494 aa  458  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 
473 aa  449  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 
481 aa  451  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  46.33 
 
 
491 aa  448  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 
479 aa  445  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
477 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
469 aa  434  1e-120  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
501 aa  430  1e-119  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
480 aa  429  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
488 aa  428  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
478 aa  427  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  44.06 
 
 
495 aa  427  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
469 aa  424  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 
469 aa  422  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 
482 aa  417  9.999999999999999e-116  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  43.17 
 
 
518 aa  418  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  43.61 
 
 
546 aa  416  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 
484 aa  418  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
484 aa  412  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
492 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
494 aa  409  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
484 aa  410  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 
483 aa  411  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 
487 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
492 aa  406  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
495 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 
484 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
493 aa  398  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  44.28 
 
 
464 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 
498 aa  396  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0321  glutamyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
498 aa  395  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
501 aa  390  1e-107  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
483 aa  391  1e-107  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 
480 aa  389  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
500 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
535 aa  385  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
496 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0161  glutamyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
498 aa  388  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361508  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 
464 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 
464 aa  380  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
468 aa  382  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
464 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
472 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
470 aa  378  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 
467 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
481 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_52655  glutamyl-trna synthase  39.92 
 
 
588 aa  376  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.233509  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
469 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
466 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 
468 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
465 aa  373  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
504 aa  375  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  40.71 
 
 
463 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
467 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
464 aa  375  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
464 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
466 aa  370  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
466 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
471 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
467 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
471 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
471 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 
466 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
472 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
467 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
471 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 
494 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
504 aa  365  1e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
481 aa  365  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
471 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
475 aa  364  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
502 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
470 aa  363  3e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>