More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0777 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
467 aa  959    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  61.21 
 
 
464 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  60.99 
 
 
464 aa  578  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  57.3 
 
 
462 aa  533  1e-150  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0592  glutamyl-tRNA synthetase  52.28 
 
 
467 aa  477  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 
477 aa  402  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  42.5 
 
 
480 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
482 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
494 aa  395  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  40.96 
 
 
495 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
490 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
491 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
484 aa  379  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 
485 aa  378  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
501 aa  375  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
487 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
496 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
467 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
485 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
469 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
469 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  40.88 
 
 
465 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
486 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  42.24 
 
 
480 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
484 aa  368  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
479 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
488 aa  363  4e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  42.37 
 
 
469 aa  361  2e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 
466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
481 aa  357  3.9999999999999996e-97  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
478 aa  355  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
492 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 
473 aa  352  7e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
485 aa  349  5e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
488 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
498 aa  346  4e-94  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  40.39 
 
 
463 aa  347  4e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
490 aa  346  6e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
495 aa  345  7e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1080  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
445 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
471 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 
499 aa  345  1e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  41.29 
 
 
546 aa  344  2e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
500 aa  342  1e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 
464 aa  342  1e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 
480 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
535 aa  339  7e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 
466 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
467 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
492 aa  337  1.9999999999999998e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
485 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 
468 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
504 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
504 aa  334  2e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
488 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
491 aa  332  6e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
490 aa  332  8e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
488 aa  332  9e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
492 aa  332  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
469 aa  332  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 
491 aa  331  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  38.98 
 
 
469 aa  331  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
469 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
470 aa  330  3e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
469 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
469 aa  330  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
474 aa  330  5.0000000000000004e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
469 aa  329  7e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
469 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  37.71 
 
 
469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
485 aa  327  3e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
471 aa  327  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
484 aa  327  4.0000000000000003e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2028  glutamyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
467 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 
468 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 
471 aa  327  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 
475 aa  326  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
469 aa  326  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
469 aa  326  5e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
471 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
471 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
471 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
509 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
471 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  34.23 
 
 
494 aa  325  9e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
491 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
491 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
469 aa  325  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
471 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
469 aa  324  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
471 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>