More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0504 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 504 aa  1043    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 		 492 aa  556  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 498 aa  551  1e-156  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  53.63 
 
 		 535 aa  541  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  48.49 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  44.49 
 
 		 495 aa  431  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 480 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 495 aa  416  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 491 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 496 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  44.85 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 482 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 485 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 487 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 484 aa  392  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 501 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 465 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 467 aa  385  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 481 aa  383  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  45.56 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 466 aa  382  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  43.71 
 
 		 467 aa  381  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 492 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 469 aa  379  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 490 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 484 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 472 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 473 aa  367  1e-100  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 486 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  40.24 
 
 		 546 aa  365  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 475 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 469 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 470 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 468 aa  365  1e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 490 aa  365  1e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  41.97 
 
 		 470 aa  365  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 466 aa  364  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 463 aa  364  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 493 aa  363  4e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 469 aa  362  9e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 464 aa  360  2e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 491 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 		 480 aa  360  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  43.65 
 
 		 464 aa  359  5e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 464 aa  359  6e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 466 aa  359  8e-98  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 480 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 509 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 469 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 475 aa  357  3.9999999999999996e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 470 aa  356  5.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 472 aa  356  5.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 471 aa  355  8.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 468 aa  355  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 477 aa  355  1e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 464 aa  355  1e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 488 aa  354  2e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 470 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 469 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 471 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  42 
 
 		 518 aa  353  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 469 aa  353  4e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 485 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 469 aa  352  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 469 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 469 aa  351  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 469 aa  351  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 469 aa  351  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 488 aa  350  3e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 469 aa  350  4e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 500 aa  349  5e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 471 aa  349  6e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 		 491 aa  349  8e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 471 aa  348  1e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 469 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 469 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 469 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 464 aa  348  1e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 471 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 469 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 471 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 		 475 aa  346  4e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 506 aa  346  6e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 474 aa  346  6e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>