More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0396 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
488 aa  1006    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  58.37 
 
 
485 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 
482 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  54.68 
 
 
485 aa  561  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 
490 aa  518  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
488 aa  493  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 
486 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 
491 aa  471  1e-132  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 
491 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 
485 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 
485 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 
485 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 
485 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 
485 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
485 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 
484 aa  462  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 
485 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
484 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
490 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
484 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  49.18 
 
 
491 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 
485 aa  457  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
491 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 
485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 
494 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
490 aa  440  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 
477 aa  434  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 
478 aa  431  1e-119  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
501 aa  426  1e-118  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
469 aa  424  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
479 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
481 aa  419  1e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 
469 aa  421  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 
469 aa  417  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
473 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 
483 aa  404  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  46.46 
 
 
484 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  41.81 
 
 
495 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  43.93 
 
 
469 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  44.56 
 
 
483 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  42.23 
 
 
467 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 
484 aa  395  1e-109  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
467 aa  395  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
483 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
488 aa  390  1e-107  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  44 
 
 
546 aa  389  1e-107  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
493 aa  391  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  41 
 
 
491 aa  390  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
499 aa  389  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
467 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
495 aa  388  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 
465 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
466 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
482 aa  385  1e-105  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  44.99 
 
 
481 aa  385  1e-105  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
498 aa  379  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  43.13 
 
 
481 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 
488 aa  380  1e-104  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
481 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
480 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
464 aa  374  1e-102  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
466 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
492 aa  369  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
468 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
466 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  41.1 
 
 
518 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 
881 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
494 aa  365  1e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 
496 aa  363  3e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 
483 aa  363  4e-99  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
472 aa  360  3e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
504 aa  359  6e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
481 aa  359  7e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 
465 aa  356  5e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
471 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
471 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
472 aa  355  1e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
500 aa  355  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
467 aa  354  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
504 aa  354  2e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 
484 aa  353  5e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
471 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
471 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
464 aa  352  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
471 aa  349  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
471 aa  349  6e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
487 aa  349  6e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
471 aa  349  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
469 aa  349  7e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
471 aa  349  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
471 aa  349  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
471 aa  349  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
469 aa  349  7e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0161  glutamyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
498 aa  349  8e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361508  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
467 aa  348  9e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
474 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
474 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  40.63 
 
 
474 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
501 aa  348  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>