More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0337 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
499 aa  1030    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  54.66 
 
 
491 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  56.91 
 
 
483 aa  564  1.0000000000000001e-159  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 
484 aa  556  1e-157  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0161  glutamyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 
498 aa  553  1e-156  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 
486 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  56.67 
 
 
484 aa  548  1e-155  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  55.49 
 
 
491 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  55.95 
 
 
484 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  56.08 
 
 
485 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  55.95 
 
 
484 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 
485 aa  535  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 
485 aa  535  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  56.3 
 
 
484 aa  537  1e-151  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 
485 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 
485 aa  535  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 
485 aa  535  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 
485 aa  535  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0321  glutamyl-tRNA synthetase  53.94 
 
 
498 aa  536  1e-151  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 
491 aa  531  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  56.29 
 
 
485 aa  533  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  55.28 
 
 
491 aa  532  1e-150  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 
501 aa  488  1e-137  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  48.78 
 
 
488 aa  460  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
485 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  44.88 
 
 
482 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
464 aa  428  1e-118  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 
485 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
490 aa  423  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  44.97 
 
 
482 aa  420  1e-116  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
485 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  46 
 
 
483 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 
490 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  44.58 
 
 
488 aa  405  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
494 aa  396  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
481 aa  386  1e-106  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 
477 aa  382  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
473 aa  384  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
488 aa  377  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 
493 aa  375  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
469 aa  375  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
469 aa  372  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
469 aa  372  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
478 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 
490 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
501 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.46 
 
 
495 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
491 aa  365  1e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
500 aa  360  4e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
481 aa  360  4e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
479 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
492 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 
480 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 
494 aa  357  2.9999999999999997e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0704  glutamyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 
482 aa  350  3e-95  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.574846  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
504 aa  350  4e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 
464 aa  350  4e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  39.71 
 
 
546 aa  350  5e-95  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 
488 aa  350  5e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
464 aa  347  2e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
464 aa  347  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
467 aa  346  5e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
492 aa  345  7e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
484 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  35.96 
 
 
487 aa  343  5e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
481 aa  342  9e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
504 aa  342  1e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
502 aa  340  4e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
481 aa  339  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
495 aa  339  8e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
464 aa  339  8e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
481 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
507 aa  338  9.999999999999999e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
496 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
881 aa  337  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 
506 aa  337  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
498 aa  335  1e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
502 aa  335  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  37 
 
 
502 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
484 aa  333  3e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  36.36 
 
 
502 aa  333  4e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
467 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
483 aa  333  5e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  37.84 
 
 
518 aa  333  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 
490 aa  331  1e-89  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
504 aa  331  2e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
491 aa  330  3e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  35.38 
 
 
500 aa  330  4e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
503 aa  330  4e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
492 aa  330  4e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2140  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
465 aa  329  6e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000804672  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
471 aa  328  2.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 
503 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
501 aa  327  3e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 
465 aa  327  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>