More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0930 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  100 
 
 		 495 aa  1025    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 479 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  54.98 
 
 		 494 aa  546  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  54.26 
 
 		 480 aa  540  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 490 aa  538  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 		 491 aa  529  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  52.66 
 
 		 501 aa  530  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  52.17 
 
 		 495 aa  528  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  47.74 
 
 		 477 aa  482  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 482 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 496 aa  462  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 		 492 aa  450  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 467 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 485 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  45.82 
 
 		 484 aa  437  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 485 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 		 487 aa  438  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 484 aa  433  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 468 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 467 aa  431  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 504 aa  431  1e-119  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 467 aa  425  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 488 aa  424  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 466 aa  421  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 466 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  44.31 
 
 		 478 aa  419  1e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 485 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 469 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 488 aa  416  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 465 aa  415  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 491 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  44.21 
 
 		 486 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 490 aa  415  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  43.42 
 
 		 480 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 		 464 aa  412  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 490 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 463 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 492 aa  402  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 		 470 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 488 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 		 481 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 498 aa  398  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  43.46 
 
 		 546 aa  400  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 471 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 471 aa  395  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 		 471 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 535 aa  398  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 471 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 471 aa  395  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 467 aa  394  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 471 aa  395  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 471 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 472 aa  395  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 468 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 470 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 471 aa  395  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  41.67 
 
 		 471 aa  395  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 471 aa  395  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 471 aa  392  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 471 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 469 aa  391  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 471 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 		 469 aa  390  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 466 aa  389  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 506 aa  387  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 475 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 509 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 471 aa  388  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2533  glutamyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000038789  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 469 aa  387  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 469 aa  386  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3216  glutamyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 470 aa  383  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 474 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 469 aa  383  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 		 472 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>