More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0204 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
506 aa  1055    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 
490 aa  541  1e-153  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
484 aa  432  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 
487 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 
484 aa  423  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 
492 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 
504 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
477 aa  402  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
492 aa  390  1e-107  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
493 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
479 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  40.6 
 
 
495 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
488 aa  384  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
494 aa  381  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
507 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
500 aa  374  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
506 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
485 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
476 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 
495 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
490 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 
505 aa  372  1e-101  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
509 aa  369  1e-101  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 
489 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
504 aa  372  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 
495 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
502 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  40.28 
 
 
493 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
506 aa  368  1e-100  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
493 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
479 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
493 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
480 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
509 aa  367  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
493 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
494 aa  367  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
482 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 
484 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
488 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 
494 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 
493 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 
493 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
493 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 
489 aa  365  1e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
514 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 
486 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
494 aa  363  6e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
503 aa  362  7.0000000000000005e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
484 aa  362  7.0000000000000005e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
502 aa  361  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 
490 aa  361  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 
491 aa  360  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
503 aa  360  4e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
493 aa  359  8e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
516 aa  359  8e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
493 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
491 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 
493 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 
502 aa  356  5.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
485 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
503 aa  355  8.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 
509 aa  354  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
504 aa  353  4e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 
502 aa  353  4e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 
488 aa  353  5.9999999999999994e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
485 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
500 aa  351  2e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
503 aa  349  6e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 
512 aa  349  7e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
492 aa  347  2e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
535 aa  347  4e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 
504 aa  346  6e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  36.06 
 
 
546 aa  345  1e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
501 aa  345  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
465 aa  343  4e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
469 aa  342  8e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
469 aa  340  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
501 aa  340  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
490 aa  338  9e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
510 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
498 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
491 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  35.27 
 
 
472 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
471 aa  335  7.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 
485 aa  335  9e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
490 aa  334  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
471 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 
470 aa  333  5e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  37.36 
 
 
517 aa  333  6e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
480 aa  332  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
480 aa  331  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 
473 aa  330  4e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
469 aa  329  7e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
496 aa  328  9e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
474 aa  329  9e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
474 aa  329  9e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
505 aa  328  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  36.97 
 
 
518 aa  327  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>