More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09840 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  76.02 
 
 		 498 aa  774    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  70.51 
 
 		 535 aa  756    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 492 aa  1017    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  57.26 
 
 		 504 aa  556  1e-157  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 490 aa  416  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 482 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  43.33 
 
 		 495 aa  402  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 485 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 479 aa  398  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 488 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 480 aa  393  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  44.01 
 
 		 494 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 485 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 467 aa  384  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 486 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 481 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  43.15 
 
 		 546 aa  374  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1806  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 509 aa  373  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 495 aa  373  1e-102  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 491 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 471 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 501 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 485 aa  369  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 477 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 470 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 480 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  41.98 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 469 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 487 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 471 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 475 aa  362  6e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 		 484 aa  362  9e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 466 aa  362  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 466 aa  362  1e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 490 aa  361  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 490 aa  360  2e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 468 aa  361  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 472 aa  360  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 467 aa  360  3e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 466 aa  359  5e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 466 aa  359  5e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004184  glutamyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 		 475 aa  359  7e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.926878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 468 aa  359  8e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 467 aa  359  8e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  43.28 
 
 		 464 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 469 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 469 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 471 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 469 aa  356  5e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 		 471 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 472 aa  356  5e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 484 aa  355  7.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 		 468 aa  355  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 492 aa  355  1e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 491 aa  354  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 493 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 469 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 471 aa  353  4e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 469 aa  353  4e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 464 aa  353  5e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 469 aa  353  5e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 463 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 469 aa  352  8e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 474 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 471 aa  351  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 		 474 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 465 aa  350  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 488 aa  351  2e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 469 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 		 470 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 485 aa  350  4e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 469 aa  350  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 469 aa  349  6e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 464 aa  349  8e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 474 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>