More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0083 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
488 aa  1011    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
494 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
491 aa  457  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  46.31 
 
 
490 aa  456  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  47.18 
 
 
477 aa  456  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
479 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
485 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
485 aa  430  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 
486 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 
482 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
491 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  44.08 
 
 
495 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
485 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  43.39 
 
 
466 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 
495 aa  413  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 
488 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
490 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
480 aa  414  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 
467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 
465 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
466 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
484 aa  398  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 
501 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
469 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
484 aa  398  9.999999999999999e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
471 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
471 aa  393  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
471 aa  393  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
471 aa  394  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
466 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
471 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
471 aa  393  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  42.68 
 
 
471 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
471 aa  393  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
471 aa  393  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
492 aa  390  1e-107  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
488 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
471 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  44.69 
 
 
478 aa  391  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 
467 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
467 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
484 aa  388  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
468 aa  385  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
490 aa  388  1e-106  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
481 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
465 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
471 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
484 aa  383  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
506 aa  384  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  41.56 
 
 
470 aa  385  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
469 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 
469 aa  385  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 
464 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 
471 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
471 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 
481 aa  379  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  41.78 
 
 
501 aa  379  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 
485 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
471 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
471 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
463 aa  381  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 
471 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
472 aa  382  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 
484 aa  378  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
471 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 
470 aa  375  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
474 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
474 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 
490 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
471 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 
469 aa  378  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 
491 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
471 aa  373  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
468 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 
468 aa  373  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
474 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1590  glutamyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
467 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  unclonable  0.000000281277 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
473 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
480 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
487 aa  375  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
502 aa  374  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2931  glutamyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
471 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.000000400457  normal  0.117314 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
471 aa  375  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
471 aa  374  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 
471 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
470 aa  374  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
491 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
472 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 
464 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 
496 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 
500 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
492 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 
504 aa  371  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
472 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 
469 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
507 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
485 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
485 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
485 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  41.06 
 
 
506 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>