More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0088 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  63.09 
 
 		 484 aa  635    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 486 aa  1001    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  68.25 
 
 		 485 aa  675    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  68.25 
 
 		 485 aa  676    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  68.25 
 
 		 485 aa  676    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  68.25 
 
 		 485 aa  676    Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  68.25 
 
 		 485 aa  676    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  87.47 
 
 		 491 aa  901    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  63.15 
 
 		 484 aa  635    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  68.04 
 
 		 491 aa  672    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  68.25 
 
 		 485 aa  687    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  68.25 
 
 		 485 aa  676    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  68.25 
 
 		 491 aa  674    Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  68.04 
 
 		 491 aa  687    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  66.6 
 
 		 485 aa  666    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  63.15 
 
 		 484 aa  635    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 499 aa  540  9.999999999999999e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 485 aa  521  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  52.83 
 
 		 483 aa  521  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  54.36 
 
 		 484 aa  520  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  51.45 
 
 		 482 aa  518  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 		 484 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 485 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 485 aa  498  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  48.77 
 
 		 488 aa  487  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 488 aa  479  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  49.48 
 
 		 483 aa  478  1e-134  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  48.34 
 
 		 482 aa  473  1e-132  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  49.59 
 
 		 477 aa  466  9.999999999999999e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 464 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 		 490 aa  462  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  47.94 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 494 aa  464  1e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0321  glutamyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 498 aa  460  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0161  glutamyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 		 498 aa  461  9.999999999999999e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361508  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  48.04 
 
 		 490 aa  456  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  45.25 
 
 		 490 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 		 481 aa  449  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 501 aa  434  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 		 479 aa  428  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  46.19 
 
 		 488 aa  427  1e-118  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 493 aa  427  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  47.51 
 
 		 478 aa  423  1e-117  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 500 aa  419  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 501 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  43.85 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  44.21 
 
 		 495 aa  413  1e-114  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 495 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 492 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 		 504 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 502 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0704  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 482 aa  400  9.999999999999999e-111  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.574846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 502 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 502 aa  395  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  43.51 
 
 		 473 aa  390  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 480 aa  392  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 504 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 503 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 469 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 469 aa  381  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 481 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 466 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 506 aa  377  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 492 aa  376  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 484 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 512 aa  374  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 487 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  40.2 
 
 		 546 aa  373  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 504 aa  372  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  41.38 
 
 		 492 aa  369  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  41.49 
 
 		 483 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 469 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 504 aa  367  1e-100  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  41.06 
 
 		 518 aa  368  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 481 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 481 aa  365  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 470 aa  364  2e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 484 aa  363  3e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  38.89 
 
 		 506 aa  363  4e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 881 aa  363  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 465 aa  362  8e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 500 aa  362  1e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 506 aa  360  2e-98  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 501 aa  360  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 483 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 466 aa  360  3e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 470 aa  360  3e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>