More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0161 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0321  glutamyl-tRNA synthetase  66.13 
 
 
498 aa  682    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0161  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
498 aa  1031    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0361508  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 
499 aa  545  1e-154  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 
484 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  52.53 
 
 
484 aa  493  9.999999999999999e-139  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  50.61 
 
 
483 aa  492  9.999999999999999e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1793  glutamyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
484 aa  492  9.999999999999999e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0101164  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  52.02 
 
 
484 aa  488  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  52.33 
 
 
485 aa  484  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
491 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0113  glutamyl-tRNA synthetase  51.65 
 
 
484 aa  476  1e-133  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000311302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
485 aa  473  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
485 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
485 aa  473  1e-132  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
485 aa  473  1e-132  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
485 aa  473  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  51.72 
 
 
485 aa  473  1e-132  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  49.4 
 
 
491 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 
491 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  51.32 
 
 
491 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  50.91 
 
 
485 aa  464  1e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  47.98 
 
 
486 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
501 aa  443  1e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
485 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
485 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
482 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
488 aa  382  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 
485 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 
464 aa  373  1e-102  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl651  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
482 aa  371  1e-101  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0130  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
483 aa  351  2e-95  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  39.72 
 
 
488 aa  349  8e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 
488 aa  343  2.9999999999999997e-93  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 
494 aa  342  5.999999999999999e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
490 aa  342  7e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
478 aa  341  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
881 aa  340  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 
490 aa  337  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
477 aa  336  5e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 
473 aa  333  5e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
481 aa  330  4e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
490 aa  327  4.0000000000000003e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
481 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
493 aa  319  6e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
481 aa  319  7.999999999999999e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
469 aa  316  6e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  37.97 
 
 
546 aa  316  6e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
479 aa  315  9e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 
483 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 
504 aa  312  6.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  38.31 
 
 
498 aa  311  2e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0704  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.574846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  38.85 
 
 
472 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 
500 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 
501 aa  309  6.999999999999999e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  46.61 
 
 
482 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
481 aa  306  5.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
481 aa  306  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 
491 aa  306  8.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  36.53 
 
 
495 aa  304  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0641  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
477 aa  303  4.0000000000000003e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 
463 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4767  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 
468 aa  301  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
488 aa  301  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 
494 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
472 aa  300  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
469 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 
469 aa  300  4e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1719  glutamyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 
477 aa  297  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04741  glutamyl-tRNA synthetase  44.66 
 
 
492 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.633658  normal  0.679149 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
487 aa  297  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
469 aa  297  3e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05371  glutamyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
493 aa  296  5e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
492 aa  296  6e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
466 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0111  glutamyl-tRNA synthetase  35.7 
 
 
462 aa  295  2e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2681  glutamyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
462 aa  295  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
506 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2734  glutamyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
469 aa  294  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  36 
 
 
466 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1600  glutamyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
469 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000105625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1376  glutamyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
469 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00012912  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1305  glutamyl-tRNA synthetase  36.47 
 
 
463 aa  294  3e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3210  glutamyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
469 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000343347  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2103  glutamyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
469 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014771  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 
484 aa  293  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2487  glutamyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
504 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000251622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2541  glutamyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
504 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20953  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2628  glutamyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
504 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.00000000191371  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 
503 aa  293  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  37.22 
 
 
501 aa  293  5e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1480  glutamyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 
463 aa  292  8e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.499307  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1806  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 
476 aa  292  8e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0434  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 
463 aa  292  9e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
465 aa  292  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1609  glutamyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 
462 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>