More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1508 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  99.39 
 
 		 493 aa  1015    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  65.11 
 
 		 493 aa  684    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  90.87 
 
 		 493 aa  939    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  90.87 
 
 		 493 aa  939    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 493 aa  1019    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  99.39 
 
 		 493 aa  1014    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  91.08 
 
 		 514 aa  941    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  97.77 
 
 		 493 aa  1002    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  82.32 
 
 		 493 aa  866    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  60.91 
 
 		 494 aa  635    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  86.41 
 
 		 493 aa  905    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  83.33 
 
 		 494 aa  874    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  64.99 
 
 		 493 aa  665    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  83.33 
 
 		 494 aa  873    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  61.7 
 
 		 509 aa  632  1e-180  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  61.28 
 
 		 509 aa  630  1e-179  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  61.49 
 
 		 505 aa  623  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 		 503 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  50.63 
 
 		 485 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 		 488 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  51.38 
 
 		 484 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 484 aa  498  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 489 aa  464  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  47.85 
 
 		 506 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 492 aa  434  1e-120  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 		 504 aa  417  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  45.21 
 
 		 479 aa  398  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 		 480 aa  395  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 500 aa  392  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  39.71 
 
 		 495 aa  372  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 506 aa  366  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 480 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 484 aa  364  2e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 492 aa  364  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  40.26 
 
 		 487 aa  363  6e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 477 aa  359  5e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 482 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 484 aa  349  8e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 479 aa  347  3e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 485 aa  346  5e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 494 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.75 
 
 		 501 aa  344  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 490 aa  343  4e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 490 aa  342  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 500 aa  340  2e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 489 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 488 aa  338  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 502 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 		 485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 512 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 509 aa  336  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 464 aa  335  1e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 491 aa  333  3e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 490 aa  333  4e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 490 aa  333  4e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 		 486 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 516 aa  333  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 502 aa  333  5e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 495 aa  332  6e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 493 aa  332  7.000000000000001e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 		 503 aa  332  7.000000000000001e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 503 aa  332  8e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 464 aa  332  8e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 490 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 502 aa  331  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 495 aa  330  5.0000000000000004e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 504 aa  329  7e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 502 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 491 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 485 aa  326  7e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 493 aa  325  1e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 501 aa  323  4e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 488 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 		 507 aa  322  9.000000000000001e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  39.79 
 
 		 546 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 		 496 aa  320  3e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 469 aa  320  3.9999999999999996e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 		 478 aa  319  7.999999999999999e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 468 aa  318  9e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 494 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 506 aa  316  6e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 501 aa  316  7e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 510 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 		 471 aa  313  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  34.73 
 
 		 467 aa  312  6.999999999999999e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 494 aa  312  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 469 aa  312  9e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 499 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 464 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 469 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01271  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 475 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  34.37 
 
 		 481 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 470 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>