More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4891 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 509 aa  1049    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  70.22 
 
 		 516 aa  747    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  66.14 
 
 		 517 aa  720    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  58.46 
 
 		 512 aa  624  1e-177  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  57.06 
 
 		 505 aa  591  1e-167  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 510 aa  554  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 		 500 aa  546  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  52.99 
 
 		 500 aa  545  1e-154  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 		 501 aa  541  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 		 511 aa  522  1e-147  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  48.33 
 
 		 502 aa  494  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 		 502 aa  392  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 503 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 502 aa  381  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 502 aa  378  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 504 aa  378  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 502 aa  376  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 492 aa  353  4e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  42.14 
 
 		 494 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 493 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 491 aa  351  2e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 493 aa  349  5e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 494 aa  347  2e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 486 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.91 
 
 		 501 aa  342  8e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 493 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 		 503 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 492 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 493 aa  339  9e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 505 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 514 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 		 482 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 493 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.61 
 
 		 495 aa  336  5e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 		 493 aa  336  5.999999999999999e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 493 aa  336  7e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 484 aa  335  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 507 aa  334  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 493 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 509 aa  333  6e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 487 aa  332  9e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 484 aa  330  3e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 476 aa  330  5.0000000000000004e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 506 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 509 aa  327  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 494 aa  326  7e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 503 aa  325  8.000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 494 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 493 aa  324  2e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 		 504 aa  323  4e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 491 aa  323  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 493 aa  322  9.000000000000001e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  39.25 
 
 		 485 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 469 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 489 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  36.72 
 
 		 490 aa  320  5e-86  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  38.77 
 
 		 469 aa  319  9e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 490 aa  318  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 489 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 485 aa  317  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 485 aa  316  7e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 479 aa  316  7e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 		 495 aa  316  7e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  35.24 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 495 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 490 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 494 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 499 aa  313  2.9999999999999996e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 490 aa  313  3.9999999999999997e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  37.35 
 
 		 546 aa  313  4.999999999999999e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 488 aa  311  2e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 478 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 506 aa  307  3e-82  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 479 aa  305  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 		 496 aa  301  1e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 480 aa  301  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 504 aa  299  8e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 484 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 480 aa  297  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 484 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 469 aa  296  5e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57984  glutamyl-tRNA synthetase, mitochondrial  35.98 
 
 		 491 aa  296  6e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.604011  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  34.67 
 
 		 504 aa  295  2e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 488 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 		 465 aa  293  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  35.59 
 
 		 491 aa  293  7e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 485 aa  292  8e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 485 aa  292  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 483 aa  291  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 488 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 473 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04820  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 467 aa  290  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  35.62 
 
 		 491 aa  289  9e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2659  glutamyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 517 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.10938  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 		 493 aa  289  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 471 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  35.41 
 
 		 485 aa  288  2e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>