More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1565 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  64.74 
 
 		 509 aa  658    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0201  glutamate--tRNA ligase  62.2 
 
 		 517 aa  654    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  71.12 
 
 		 501 aa  690    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1261  glutamyl-tRNA synthetase  62.8 
 
 		 506 aa  654    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1202  glutamyl-tRNA synthetase  75.25 
 
 		 503 aa  738    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  68.55 
 
 		 505 aa  696    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  65.06 
 
 		 504 aa  640    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 499 aa  989    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  65.52 
 
 		 504 aa  650    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  73.95 
 
 		 509 aa  759    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  63.98 
 
 		 501 aa  625  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  64.92 
 
 		 496 aa  623  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  65.3 
 
 		 490 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  65.3 
 
 		 490 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  65.09 
 
 		 490 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  64.67 
 
 		 491 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  64.4 
 
 		 495 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  61.69 
 
 		 532 aa  608  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  63.38 
 
 		 504 aa  610  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08640  glutamyl-tRNA synthetase  65.99 
 
 		 525 aa  603  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  62.3 
 
 		 493 aa  591  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  63.58 
 
 		 494 aa  588  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  58.28 
 
 		 492 aa  586  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  63.21 
 
 		 512 aa  585  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  62.3 
 
 		 491 aa  587  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  63.75 
 
 		 490 aa  581  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  59.03 
 
 		 494 aa  546  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 504 aa  398  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 482 aa  353  4e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 477 aa  349  7e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 485 aa  343  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 498 aa  342  9e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 490 aa  339  5.9999999999999996e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 488 aa  338  9.999999999999999e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 500 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 492 aa  332  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 491 aa  329  6e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 484 aa  329  7e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 507 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 		 495 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 		 486 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  37.83 
 
 		 495 aa  324  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 491 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 503 aa  322  8e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 493 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 484 aa  322  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 504 aa  322  9.999999999999999e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 		 485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 490 aa  320  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 494 aa  320  3e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  37.1 
 
 		 506 aa  320  5e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 488 aa  319  9e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 492 aa  317  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 496 aa  317  3e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  34.76 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 468 aa  315  8e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 493 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 493 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 505 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 535 aa  312  9e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 514 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 488 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 484 aa  310  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 484 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 484 aa  310  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 		 469 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 503 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  35.09 
 
 		 478 aa  307  3e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  34.42 
 
 		 479 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 493 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 495 aa  306  7e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2363  glutamyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 475 aa  305  8.000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.511106  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 485 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 466 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 492 aa  305  9.000000000000001e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 466 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 504 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 481 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 488 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 494 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 		 469 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 494 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 501 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  34.43 
 
 		 469 aa  303  7.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 491 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 491 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 485 aa  301  1e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 467 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 		 464 aa  300  4e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 455 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 		 480 aa  300  4e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 463 aa  300  5e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>