More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0201 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0201  glutamate--tRNA ligase  100 
 
 		 517 aa  1060    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1261  glutamyl-tRNA synthetase  84.33 
 
 		 506 aa  895    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1202  glutamyl-tRNA synthetase  64.19 
 
 		 503 aa  648    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  65.06 
 
 		 505 aa  674    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  63.39 
 
 		 504 aa  641    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  64.23 
 
 		 509 aa  665    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  62.42 
 
 		 499 aa  644    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  59.45 
 
 		 509 aa  625  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  60.63 
 
 		 504 aa  626  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 		 501 aa  609  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 496 aa  590  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08640  glutamyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 525 aa  586  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  57.73 
 
 		 501 aa  579  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  59.63 
 
 		 493 aa  578  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  58.2 
 
 		 504 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  56 
 
 		 532 aa  571  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 		 495 aa  569  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  56.91 
 
 		 491 aa  567  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 		 490 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 		 490 aa  566  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  56.68 
 
 		 494 aa  562  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 		 490 aa  564  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 492 aa  553  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 491 aa  548  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  53.74 
 
 		 512 aa  532  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  55.49 
 
 		 490 aa  529  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 494 aa  482  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 		 485 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 504 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 		 494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 482 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 490 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 487 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 484 aa  325  1e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 488 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 469 aa  323  4e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 496 aa  323  4e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 469 aa  320  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 484 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 485 aa  320  5e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 500 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 469 aa  315  9e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 501 aa  315  9e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 477 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 492 aa  312  6.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 491 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 504 aa  310  4e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 488 aa  310  4e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  35.69 
 
 		 486 aa  310  5e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  35.16 
 
 		 490 aa  310  5.9999999999999995e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 505 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  34.14 
 
 		 484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  35.04 
 
 		 495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 473 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 504 aa  307  3e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 		 479 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  36.87 
 
 		 503 aa  306  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 485 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 		 491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 		 506 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 491 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 		 485 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 495 aa  302  8.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 485 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 490 aa  302  1e-80  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 491 aa  302  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 480 aa  302  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 491 aa  302  1e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 485 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 485 aa  300  3e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 485 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 485 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 485 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 		 478 aa  300  3e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 485 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 507 aa  300  4e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  35.64 
 
 		 464 aa  300  6e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 493 aa  299  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  34.68 
 
 		 488 aa  297  4e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 509 aa  296  5e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 		 464 aa  296  5e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 467 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 		 506 aa  295  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  34.62 
 
 		 481 aa  294  3e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 492 aa  293  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  34.34 
 
 		 488 aa  293  5e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 492 aa  291  1e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  33.81 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  34.52 
 
 		 509 aa  290  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2647  glutamyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 463 aa  289  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018952  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 		 484 aa  287  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  33.2 
 
 		 484 aa  287  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 471 aa  286  5e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 		 484 aa  286  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 467 aa  286  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 489 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>