More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18620 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  65.67 
 
 		 504 aa  671    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08640  glutamyl-tRNA synthetase  66.26 
 
 		 525 aa  652    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  65.48 
 
 		 509 aa  680    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 509 aa  1030    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  64.07 
 
 		 505 aa  662    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1202  glutamyl-tRNA synthetase  65.27 
 
 		 503 aa  665    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  65.25 
 
 		 504 aa  649    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  65.02 
 
 		 501 aa  654    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  64.96 
 
 		 499 aa  644    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1261  glutamyl-tRNA synthetase  61.38 
 
 		 506 aa  629  1e-179  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  60.34 
 
 		 532 aa  628  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  64.18 
 
 		 493 aa  629  1e-179  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0201  glutamate--tRNA ligase  59.45 
 
 		 517 aa  625  1e-178  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  58.57 
 
 		 492 aa  613  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  62.15 
 
 		 494 aa  608  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  60.87 
 
 		 512 aa  608  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  61.89 
 
 		 490 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  60.82 
 
 		 501 aa  598  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  61.89 
 
 		 490 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  61.68 
 
 		 490 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  59.05 
 
 		 496 aa  597  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  60.67 
 
 		 504 aa  595  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  60.24 
 
 		 491 aa  594  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  59.18 
 
 		 491 aa  587  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  60.41 
 
 		 495 aa  588  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  59.8 
 
 		 490 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 494 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 490 aa  361  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 504 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 506 aa  354  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 501 aa  347  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 486 aa  342  8e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 485 aa  342  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 494 aa  338  9.999999999999999e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  41.32 
 
 		 507 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  42 
 
 		 496 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 491 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 503 aa  334  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 484 aa  334  3e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 		 487 aa  332  8e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 498 aa  330  4e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 491 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 484 aa  327  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 492 aa  323  3e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 485 aa  323  4e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 		 488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 535 aa  320  5e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 491 aa  319  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 485 aa  319  7e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 491 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.35 
 
 		 479 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 468 aa  317  4e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 477 aa  316  7e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 		 484 aa  315  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  37.11 
 
 		 495 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 469 aa  311  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 504 aa  311  2e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 485 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 492 aa  310  4e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 		 469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 488 aa  307  3e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 484 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 		 484 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  37.15 
 
 		 546 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  36.04 
 
 		 488 aa  300  5e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  35.32 
 
 		 481 aa  298  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 495 aa  298  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  34.65 
 
 		 490 aa  297  3e-79  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 		 463 aa  297  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  36.06 
 
 		 493 aa  297  4e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 495 aa  296  6e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 467 aa  296  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  34.9 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 478 aa  295  1e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 455 aa  295  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 488 aa  294  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 		 469 aa  293  4e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 480 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  36.22 
 
 		 469 aa  291  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  34.2 
 
 		 490 aa  290  4e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2363  glutamyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 475 aa  289  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.511106  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 467 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  33.92 
 
 		 504 aa  288  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  38.52 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 466 aa  288  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 484 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 		 473 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  34.81 
 
 		 506 aa  286  4e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>