More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3717 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
488 aa  1006    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  83.75 
 
 
485 aa  857    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  79.88 
 
 
484 aa  818    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  96.48 
 
 
484 aa  946    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 
493 aa  531  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 
505 aa  512  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  51.28 
 
 
493 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
493 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  51.49 
 
 
493 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 
493 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 
493 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 
514 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  51.04 
 
 
494 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  50.62 
 
 
494 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
493 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
493 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
509 aa  500  1e-140  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  49.37 
 
 
509 aa  497  1e-139  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 
493 aa  498  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  50.53 
 
 
503 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 
493 aa  488  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
494 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  46.04 
 
 
506 aa  432  1e-120  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
489 aa  419  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
504 aa  418  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 
504 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  52.15 
 
 
492 aa  377  1e-103  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
500 aa  372  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 
476 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
506 aa  367  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
490 aa  366  1e-100  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 
480 aa  360  3e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
479 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
486 aa  349  6e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
484 aa  347  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 
492 aa  347  2e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
487 aa  345  2e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
489 aa  343  2.9999999999999997e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
494 aa  343  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
491 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
484 aa  342  8e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
495 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
480 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 
482 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
493 aa  332  1e-89  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
477 aa  331  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 
488 aa  329  7e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  37.27 
 
 
495 aa  328  9e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
485 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
490 aa  326  6e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
490 aa  324  2e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
504 aa  323  4e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
485 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
502 aa  319  6e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
488 aa  319  7.999999999999999e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 
503 aa  319  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 
503 aa  319  7.999999999999999e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
494 aa  319  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 
502 aa  318  1e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
485 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
502 aa  318  2e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
496 aa  316  6e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
501 aa  316  7e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
506 aa  316  7e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
464 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 
485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  35.28 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 
469 aa  314  2.9999999999999996e-84  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
507 aa  312  7.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 
491 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
504 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
504 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
502 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 
495 aa  310  5e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 
504 aa  308  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
503 aa  307  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
499 aa  307  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
479 aa  307  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 
516 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 
498 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
484 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  35.31 
 
 
492 aa  303  4.0000000000000003e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
484 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 
491 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
484 aa  301  1e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  45.53 
 
 
512 aa  301  1e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  37.88 
 
 
501 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
490 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
491 aa  300  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
491 aa  300  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 
469 aa  299  6e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
500 aa  299  8e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 
509 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
510 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  36.74 
 
 
464 aa  298  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1261  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 
506 aa  298  2e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  37.96 
 
 
493 aa  297  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 
469 aa  296  5e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>