More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2133 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  72.78 
 
 
504 aa  721    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  85.83 
 
 
490 aa  838    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  72.04 
 
 
494 aa  705    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  88.22 
 
 
491 aa  866    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  78.51 
 
 
490 aa  741    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  85.83 
 
 
490 aa  838    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
495 aa  992    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  85.42 
 
 
490 aa  835    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  65.09 
 
 
493 aa  631  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  67.15 
 
 
496 aa  627  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  63.58 
 
 
505 aa  616  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  63.08 
 
 
509 aa  613  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  64.98 
 
 
501 aa  610  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1202  glutamyl-tRNA synthetase  62.84 
 
 
503 aa  609  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461842  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  62.78 
 
 
504 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  61.59 
 
 
492 aa  607  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  64.51 
 
 
499 aa  607  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  61.96 
 
 
504 aa  595  1e-169  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  62.8 
 
 
512 aa  589  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 
509 aa  589  1e-167  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  59.3 
 
 
532 aa  584  1.0000000000000001e-165  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  63.49 
 
 
501 aa  583  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  60.25 
 
 
491 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0201  glutamate--tRNA ligase  57.43 
 
 
517 aa  570  1e-161  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08640  glutamyl-tRNA synthetase  64.33 
 
 
525 aa  567  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1261  glutamyl-tRNA synthetase  56.97 
 
 
506 aa  560  1e-158  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  56.01 
 
 
494 aa  524  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  46.25 
 
 
504 aa  374  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
484 aa  347  3e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
487 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 
469 aa  333  6e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
494 aa  330  3e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 
484 aa  330  4e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 
498 aa  328  9e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
470 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.78 
 
 
485 aa  326  6e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 
504 aa  325  1e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
490 aa  323  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 
492 aa  323  6e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
491 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
469 aa  319  6e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
468 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  37.25 
 
 
495 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
478 aa  317  2e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  37.16 
 
 
469 aa  317  4e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
486 aa  316  6e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 
485 aa  316  8e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 
482 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 
535 aa  315  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
468 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
501 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 
488 aa  313  5.999999999999999e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
503 aa  312  6.999999999999999e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 
477 aa  311  1e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
496 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
488 aa  310  5e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
480 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
488 aa  309  8e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 
455 aa  309  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
500 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 
506 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 
491 aa  307  3e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  40.84 
 
 
507 aa  307  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 
462 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
492 aa  306  7e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  38.62 
 
 
491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 
464 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
471 aa  305  2.0000000000000002e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 
479 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2363  glutamyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 
475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.511106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8974  glutamyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 
471 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135542  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
481 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  39.14 
 
 
485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 
467 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
484 aa  302  7.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  35.93 
 
 
485 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
495 aa  302  8.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
505 aa  302  9e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  34.94 
 
 
464 aa  301  1e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
455 aa  302  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
488 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 
471 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
509 aa  301  2e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 
484 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  36.2 
 
 
484 aa  298  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 
490 aa  299  1e-79  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 
506 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 
509 aa  298  2e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
484 aa  298  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>