More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1338 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 494 aa  1009    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  60.77 
 
 		 491 aa  611  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 504 aa  579  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  58.01 
 
 		 493 aa  570  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  59.66 
 
 		 501 aa  565  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  57.23 
 
 		 501 aa  555  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  59.38 
 
 		 499 aa  555  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 		 494 aa  548  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 		 509 aa  547  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  56.03 
 
 		 504 aa  544  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  58.52 
 
 		 496 aa  545  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  55.05 
 
 		 509 aa  539  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  56.91 
 
 		 491 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1202  glutamyl-tRNA synthetase  57.49 
 
 		 503 aa  539  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  54.73 
 
 		 492 aa  539  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  56.01 
 
 		 495 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  55.1 
 
 		 490 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 512 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  55.1 
 
 		 490 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 490 aa  529  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08640  glutamyl-tRNA synthetase  58.04 
 
 		 525 aa  522  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  53.72 
 
 		 505 aa  524  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 504 aa  522  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  54.69 
 
 		 490 aa  503  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1261  glutamyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 506 aa  498  1e-140  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  51.29 
 
 		 532 aa  501  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0201  glutamate--tRNA ligase  51.33 
 
 		 517 aa  493  9.999999999999999e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 504 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 482 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 490 aa  382  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 		 484 aa  370  1e-101  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 487 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 485 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 		 488 aa  363  3e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 506 aa  363  4e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 501 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  39.4 
 
 		 496 aa  360  4e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 486 aa  358  9e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 491 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 507 aa  355  8.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 485 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 488 aa  355  1e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 491 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 		 490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 503 aa  353  4e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 466 aa  352  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 465 aa  351  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  39.22 
 
 		 495 aa  351  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 491 aa  350  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 477 aa  350  3e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 485 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 485 aa  348  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 485 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 485 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 485 aa  348  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 485 aa  348  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 485 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 488 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 		 491 aa  347  2e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 490 aa  348  2e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 478 aa  346  4e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 491 aa  347  4e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 503 aa  346  5e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 479 aa  346  6e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 505 aa  346  6e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 504 aa  346  7e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 467 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 498 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 495 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 		 480 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 509 aa  342  7e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 468 aa  342  9e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 535 aa  341  2e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 492 aa  340  4e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 509 aa  339  5e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 504 aa  339  8e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 494 aa  338  9.999999999999999e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 467 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  39.76 
 
 		 495 aa  337  1.9999999999999998e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 499 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 474 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 469 aa  335  7.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 471 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 		 484 aa  335  1e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 485 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.29 
 
 		 492 aa  335  1e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 469 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 467 aa  335  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 474 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 474 aa  335  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 481 aa  333  3e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 455 aa  333  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  38.24 
 
 		 546 aa  332  7.000000000000001e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 484 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 		 506 aa  331  2e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>