More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2880 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  64.71 
 
 
493 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  63.52 
 
 
494 aa  661    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  65.98 
 
 
493 aa  681    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  64.3 
 
 
493 aa  677    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  66.19 
 
 
493 aa  681    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  62.24 
 
 
509 aa  638    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
493 aa  1021    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  64.91 
 
 
493 aa  683    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  65.11 
 
 
493 aa  684    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  65.37 
 
 
514 aa  675    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  62.47 
 
 
493 aa  649    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  65.78 
 
 
503 aa  694    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  66.94 
 
 
494 aa  701    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  62.04 
 
 
509 aa  639    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  63.69 
 
 
493 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  63.93 
 
 
494 aa  662    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  68.57 
 
 
493 aa  687    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  63.27 
 
 
505 aa  632  1e-180  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  54.22 
 
 
488 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 
484 aa  528  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  52.84 
 
 
485 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  51.69 
 
 
484 aa  507  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 
506 aa  478  1e-134  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 
489 aa  464  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
492 aa  444  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
476 aa  429  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  47.79 
 
 
504 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  47.43 
 
 
479 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  44.02 
 
 
504 aa  418  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 
480 aa  415  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  43.5 
 
 
500 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
506 aa  387  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 
492 aa  381  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
484 aa  375  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
487 aa  368  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
484 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 
479 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.76 
 
 
495 aa  358  9.999999999999999e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  38.96 
 
 
502 aa  355  1e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 
490 aa  353  5e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  39.51 
 
 
494 aa  353  5e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
502 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 
503 aa  352  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
509 aa  352  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
510 aa  351  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  37.11 
 
 
480 aa  350  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 
490 aa  350  3e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 
482 aa  349  7e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 
503 aa  347  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 
504 aa  347  3e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 
516 aa  346  5e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
502 aa  345  8.999999999999999e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
507 aa  345  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  37 
 
 
502 aa  343  5e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 
477 aa  342  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 
501 aa  339  7e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 
490 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
495 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
489 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  37.07 
 
 
496 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
464 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 
506 aa  331  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 
485 aa  331  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
493 aa  331  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 
517 aa  330  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
490 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 
469 aa  327  2.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.62 
 
 
512 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
478 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 
468 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  38.53 
 
 
546 aa  325  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  37.12 
 
 
503 aa  323  4e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 
495 aa  323  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
491 aa  323  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
464 aa  322  8e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 
486 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.98 
 
 
485 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 
488 aa  320  5e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
494 aa  320  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.25 
 
 
491 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 
500 aa  318  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  35.73 
 
 
464 aa  318  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  39.17 
 
 
502 aa  318  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 
501 aa  318  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
499 aa  316  7e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
464 aa  316  7e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 
511 aa  315  9.999999999999999e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
491 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
498 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 
504 aa  311  1e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
469 aa  311  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
494 aa  311  2e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
492 aa  310  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1261  glutamyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
506 aa  310  4e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  35.52 
 
 
493 aa  309  6.999999999999999e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 
469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0777  glutamyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 
467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.980364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>