More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0181 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3375  glutamyl-tRNA synthetase  68.44 
 
 		 465 aa  635    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  68.71 
 
 		 469 aa  641    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0623  glutamyl-tRNA synthetase  83.33 
 
 		 477 aa  811    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.122003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  69.96 
 
 		 455 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8974  glutamyl-tRNA synthetase  69.59 
 
 		 471 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 481 aa  979    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2647  glutamyl-tRNA synthetase  66.03 
 
 		 463 aa  618  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018952  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  70.36 
 
 		 455 aa  619  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2363  glutamyl-tRNA synthetase  66.52 
 
 		 475 aa  605  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.511106  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1684  glutamyl-tRNA synthetase  62.45 
 
 		 500 aa  579  1e-164  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0521087  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3219  glutamyl-tRNA synthetase  66.6 
 
 		 470 aa  570  1e-161  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00410976  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 		 468 aa  381  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 468 aa  355  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 472 aa  346  5e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 463 aa  340  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  38.08 
 
 		 479 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 471 aa  337  3.9999999999999995e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 480 aa  335  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 482 aa  333  5e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 464 aa  332  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 498 aa  330  3e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 470 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 494 aa  329  6e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 492 aa  329  6e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 490 aa  327  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 487 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 468 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 493 aa  327  3e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 466 aa  324  2e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 		 492 aa  323  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.45 
 
 		 495 aa  323  5e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 467 aa  323  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 484 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 494 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 477 aa  319  5e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 469 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.09 
 
 		 484 aa  318  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 491 aa  317  4e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 475 aa  316  7e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 		 501 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 480 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  36.85 
 
 		 491 aa  312  6.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 466 aa  311  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 465 aa  310  5e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 469 aa  310  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 512 aa  306  7e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 481 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  34.86 
 
 		 480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 		 501 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 469 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 469 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 504 aa  305  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 469 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 469 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 		 469 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 488 aa  303  4.0000000000000003e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  32.35 
 
 		 466 aa  303  4.0000000000000003e-81  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 469 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  38.65 
 
 		 485 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 473 aa  303  6.000000000000001e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 486 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 464 aa  302  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 490 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 469 aa  302  1e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 		 535 aa  301  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0683  glutamyl-tRNA synthetase  39.28 
 
 		 467 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 464 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 469 aa  301  2e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 		 469 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 		 490 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  40.31 
 
 		 532 aa  299  6e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 463 aa  299  9e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 474 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 471 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 494 aa  298  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 492 aa  297  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 467 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  35.79 
 
 		 490 aa  296  4e-79  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 474 aa  296  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 474 aa  296  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2350  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 474 aa  296  5e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2123  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 468 aa  296  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000117381  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>