More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1684 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  69.33 
 
 		 469 aa  660    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1684  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 500 aa  1002    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0521087  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3375  glutamyl-tRNA synthetase  68.99 
 
 		 465 aa  660    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3219  glutamyl-tRNA synthetase  75.3 
 
 		 470 aa  714    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00410976  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2647  glutamyl-tRNA synthetase  64.44 
 
 		 463 aa  631  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018952  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  64.49 
 
 		 455 aa  614  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8974  glutamyl-tRNA synthetase  62.86 
 
 		 471 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2363  glutamyl-tRNA synthetase  63.56 
 
 		 475 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.511106  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  63.04 
 
 		 481 aa  598  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0623  glutamyl-tRNA synthetase  62.55 
 
 		 477 aa  593  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.122003  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  63.88 
 
 		 455 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 468 aa  386  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 464 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 479 aa  333  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 468 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 490 aa  327  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 469 aa  324  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 466 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 466 aa  323  3e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  36.88 
 
 		 491 aa  323  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 		 480 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 482 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 477 aa  318  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 472 aa  312  6.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 471 aa  309  6.999999999999999e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 476 aa  309  6.999999999999999e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 		 487 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  38.06 
 
 		 467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 		 492 aa  307  2.0000000000000002e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 501 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  36.93 
 
 		 470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 498 aa  306  6e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 464 aa  306  7e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 484 aa  306  8.000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  40.54 
 
 		 494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 485 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  36.29 
 
 		 465 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 466 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.34 
 
 		 494 aa  303  5.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 535 aa  303  6.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 485 aa  302  9e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 492 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 475 aa  302  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 491 aa  302  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 480 aa  300  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  37.53 
 
 		 465 aa  300  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 467 aa  299  8e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 467 aa  299  9e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 		 466 aa  296  5e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 492 aa  296  5e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  36.58 
 
 		 488 aa  296  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 468 aa  295  9e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 480 aa  295  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 		 472 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 493 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 504 aa  295  2e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 		 484 aa  295  2e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  35.53 
 
 		 466 aa  295  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  34.98 
 
 		 495 aa  295  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 		 473 aa  295  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3604  glutamyl-tRNA synthetase  40.12 
 
 		 444 aa  293  3e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 472 aa  293  4e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 474 aa  292  7e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 		 473 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 467 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 490 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 469 aa  290  6e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  34.89 
 
 		 469 aa  289  7e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 469 aa  289  8e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 469 aa  289  8e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 		 469 aa  289  8e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 495 aa  289  1e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2031  glutamyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 487 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  34.75 
 
 		 469 aa  287  4e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  33.66 
 
 		 490 aa  287  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1805  glutamyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 471 aa  287  4e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.492477  normal  0.241185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 474 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 474 aa  286  7e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 		 469 aa  286  8e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 512 aa  286  9e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 463 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 		 469 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3092  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 471 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.45014 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 		 490 aa  284  3.0000000000000004e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 473 aa  284  3.0000000000000004e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  34.21 
 
 		 470 aa  284  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 474 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 		 468 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 473 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 		 474 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  34.54 
 
 		 469 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1626  glutamyl-tRNA synthetase  34.88 
 
 		 470 aa  283  5.000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0744892  normal  0.201462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>