More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1475 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
512 aa  1014    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  64.97 
 
 
493 aa  624  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  64.37 
 
 
501 aa  621  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  63.95 
 
 
490 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  60.87 
 
 
509 aa  608  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 
490 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 
490 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  61.6 
 
 
504 aa  599  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  60 
 
 
492 aa  599  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  62.88 
 
 
501 aa  595  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  65.3 
 
 
496 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  63.24 
 
 
491 aa  594  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  63.27 
 
 
494 aa  592  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  63.39 
 
 
495 aa  588  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  59.92 
 
 
509 aa  587  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  60.45 
 
 
504 aa  586  1e-166  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1202  glutamyl-tRNA synthetase  62.25 
 
 
503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461842  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  59.39 
 
 
505 aa  576  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  63.2 
 
 
499 aa  574  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  60.04 
 
 
504 aa  573  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  62.24 
 
 
490 aa  566  1e-160  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08640  glutamyl-tRNA synthetase  62.35 
 
 
525 aa  566  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  57.85 
 
 
532 aa  551  1e-156  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1261  glutamyl-tRNA synthetase  55.15 
 
 
506 aa  540  9.999999999999999e-153  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  56.42 
 
 
491 aa  533  1e-150  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0201  glutamate--tRNA ligase  53.74 
 
 
517 aa  532  1e-150  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 
494 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
504 aa  356  5e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 
490 aa  339  7e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 
498 aa  338  9.999999999999999e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
492 aa  328  1.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
487 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 
468 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
504 aa  323  3e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.2 
 
 
484 aa  322  9.000000000000001e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 
535 aa  322  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
484 aa  318  1e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 
477 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
467 aa  316  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
496 aa  315  9.999999999999999e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  39.02 
 
 
546 aa  315  9.999999999999999e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 
505 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 
455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
465 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 
495 aa  313  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.95 
 
 
494 aa  312  9e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
506 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 
500 aa  311  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 
485 aa  311  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 
491 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 
469 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 
485 aa  307  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
493 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
493 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 
493 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 
466 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
481 aa  306  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 
493 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 
509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 
492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 
493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
455 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
503 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
486 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
491 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
514 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
507 aa  303  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  38.18 
 
 
493 aa  302  8.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  34.36 
 
 
480 aa  302  9e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 
509 aa  301  1e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  36.85 
 
 
495 aa  301  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  35.54 
 
 
491 aa  300  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
493 aa  300  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
485 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
485 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
485 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
493 aa  299  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
485 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
485 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3375  glutamyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 
465 aa  299  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
485 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  35.15 
 
 
491 aa  297  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
488 aa  296  4e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  36.03 
 
 
485 aa  296  5e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
479 aa  296  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  36.57 
 
 
464 aa  296  7e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0623  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
477 aa  295  9e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.122003  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
478 aa  295  1e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
469 aa  295  1e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  34.55 
 
 
484 aa  295  2e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  35.6 
 
 
488 aa  295  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  36.33 
 
 
501 aa  294  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 
499 aa  294  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
506 aa  294  3e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
468 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
470 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
494 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  36.01 
 
 
469 aa  293  5e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>