More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8974 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  69.59 
 
 		 481 aa  649    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0623  glutamyl-tRNA synthetase  71.52 
 
 		 477 aa  674    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.122003  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2363  glutamyl-tRNA synthetase  70.97 
 
 		 475 aa  667    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.511106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8974  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 471 aa  962    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2647  glutamyl-tRNA synthetase  66.59 
 
 		 463 aa  623  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018952  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3375  glutamyl-tRNA synthetase  66.74 
 
 		 465 aa  614  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  67.39 
 
 		 455 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  65.58 
 
 		 455 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1684  glutamyl-tRNA synthetase  62.86 
 
 		 500 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0521087  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3219  glutamyl-tRNA synthetase  66.16 
 
 		 470 aa  582  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00410976  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 479 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 466 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 487 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 477 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 484 aa  333  4e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 484 aa  330  3e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 470 aa  330  4e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 490 aa  329  7e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 468 aa  322  9.000000000000001e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 463 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.25 
 
 		 495 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 469 aa  317  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 498 aa  317  4e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  39.49 
 
 		 471 aa  316  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 468 aa  315  9e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 473 aa  315  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2028  glutamyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 467 aa  311  1e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 480 aa  312  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 469 aa  309  5.9999999999999995e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 491 aa  309  8e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04820  glutamyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 465 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 467 aa  307  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 466 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 482 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  38.57 
 
 		 492 aa  306  5.0000000000000004e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 494 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 493 aa  305  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1209  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 467 aa  305  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0142351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 490 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 464 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 480 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  41.68 
 
 		 495 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 472 aa  303  5.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  41.7 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 471 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 535 aa  300  3e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 		 473 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 		 466 aa  300  5e-80  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 475 aa  299  6e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 492 aa  299  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1950  glutamyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 467 aa  299  7e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  34.96 
 
 		 480 aa  299  7e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 495 aa  299  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 471 aa  299  8e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 471 aa  299  9e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 465 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 471 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 471 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2649  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000633167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 490 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 490 aa  297  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2798  glutamyl-tRNA synthetase  36.95 
 
 		 472 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0783891  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 471 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 471 aa  296  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  37.89 
 
 		 471 aa  296  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 471 aa  296  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 471 aa  296  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 471 aa  296  6e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 471 aa  296  6e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  36.5 
 
 		 466 aa  296  7e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 490 aa  296  7e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 471 aa  296  8e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 485 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 491 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 468 aa  294  2e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 467 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 469 aa  294  2e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1952  glutamyl-tRNA synthetase  38.53 
 
 		 472 aa  294  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 469 aa  294  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 466 aa  294  3e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 471 aa  293  4e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  36.79 
 
 		 469 aa  292  7e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  35.11 
 
 		 470 aa  292  7e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 504 aa  293  7e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>