More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0623 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0623  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 477 aa  971    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.122003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  69.81 
 
 		 455 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8974  glutamyl-tRNA synthetase  71.52 
 
 		 471 aa  674    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  83.33 
 
 		 481 aa  811    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  70.79 
 
 		 455 aa  628  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  68.37 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3375  glutamyl-tRNA synthetase  68.02 
 
 		 465 aa  618  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2363  glutamyl-tRNA synthetase  67.23 
 
 		 475 aa  614  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.511106  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2647  glutamyl-tRNA synthetase  64.77 
 
 		 463 aa  600  1e-170  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1684  glutamyl-tRNA synthetase  62.15 
 
 		 500 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0521087  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3219  glutamyl-tRNA synthetase  64.08 
 
 		 470 aa  560  1e-158  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00410976  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  49.26 
 
 		 468 aa  405  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 477 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 463 aa  336  5e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 464 aa  333  4e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 468 aa  333  5e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 471 aa  332  1e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  41.12 
 
 		 490 aa  331  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 472 aa  331  2e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 492 aa  329  6e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 482 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 467 aa  326  5e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 470 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 466 aa  323  6e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 		 466 aa  323  6e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 		 468 aa  322  7e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 487 aa  322  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 480 aa  319  7.999999999999999e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  39.83 
 
 		 495 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 491 aa  317  4e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 484 aa  316  5e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 498 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 467 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  39.84 
 
 		 494 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 473 aa  315  1.9999999999999998e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 484 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 491 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 		 469 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2906  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 469 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000836575  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2207  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000288711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  42.68 
 
 		 491 aa  307  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  38.8 
 
 		 468 aa  307  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  37.61 
 
 		 469 aa  307  3e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 475 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1456  glutamyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 		 469 aa  306  6e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000100274  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  39.13 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 492 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1554  glutamyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000003282  normal  0.0351282 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2499  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 469 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000172182  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2822  glutamyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000059188  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2947  glutamyl-tRNA synthetase  38.87 
 
 		 469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000528448  normal  0.145781 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 490 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 501 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  36.63 
 
 		 480 aa  303  5.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 466 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4767  glutamyl-tRNA synthetase  38.02 
 
 		 468 aa  303  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156269 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 470 aa  302  8.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2802  glutamyl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 469 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000260001  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 464 aa  301  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1430  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 469 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000061517  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1418  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 469 aa  301  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000145575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 473 aa  302  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  37.91 
 
 		 481 aa  301  2e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 469 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000124879  normal  0.0325353 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  35.92 
 
 		 470 aa  300  3e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 490 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  40.52 
 
 		 504 aa  300  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 465 aa  300  5e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 496 aa  299  9e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 465 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2224  glutamyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 467 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 485 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 473 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 		 466 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2714  glutamyl-tRNA synthetase  36.86 
 
 		 469 aa  298  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000169422  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 473 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 504 aa  297  3e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  33.12 
 
 		 466 aa  297  3e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1865  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 478 aa  297  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0276078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  39.1 
 
 		 490 aa  296  6e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 474 aa  296  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 512 aa  295  8e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 474 aa  296  8e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  37.99 
 
 		 492 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 491 aa  295  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 495 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>