More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3615 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 469 aa  953    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1684  glutamyl-tRNA synthetase  68.92 
 
 		 500 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0521087  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3375  glutamyl-tRNA synthetase  94.84 
 
 		 465 aa  909    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  69.44 
 
 		 455 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2647  glutamyl-tRNA synthetase  71.24 
 
 		 463 aa  665    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  68.71 
 
 		 481 aa  641    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0623  glutamyl-tRNA synthetase  68.37 
 
 		 477 aa  624  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.122003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8974  glutamyl-tRNA synthetase  67.74 
 
 		 471 aa  624  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3219  glutamyl-tRNA synthetase  70.45 
 
 		 470 aa  616  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00410976  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2363  glutamyl-tRNA synthetase  68.02 
 
 		 475 aa  615  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.511106  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  67.95 
 
 		 455 aa  611  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 468 aa  411  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 490 aa  350  4e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 487 aa  348  1e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 468 aa  345  8e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  39.16 
 
 		 479 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  41.37 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 466 aa  339  7e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 466 aa  339  7e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 472 aa  336  5.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 491 aa  334  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 464 aa  334  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 482 aa  333  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 463 aa  332  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 470 aa  329  6e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 468 aa  327  3e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 493 aa  326  5e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 494 aa  325  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 491 aa  323  3e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 469 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  35.22 
 
 		 480 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 494 aa  321  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 492 aa  318  9e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  39.23 
 
 		 467 aa  317  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 501 aa  317  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 477 aa  316  7e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  41.03 
 
 		 532 aa  315  9.999999999999999e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 476 aa  315  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 480 aa  312  7.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 474 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 498 aa  312  9e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  36.64 
 
 		 492 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 465 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 474 aa  309  8e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 475 aa  309  9e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  41.41 
 
 		 512 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  36.1 
 
 		 495 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 504 aa  307  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 467 aa  307  3e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 480 aa  306  6e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 501 aa  306  6e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 492 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 473 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 474 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 466 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 490 aa  303  6.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 485 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 504 aa  302  8.000000000000001e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 468 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 501 aa  301  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 		 466 aa  300  3e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 496 aa  298  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  37.02 
 
 		 473 aa  298  1e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 474 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 464 aa  298  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 		 469 aa  298  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 504 aa  297  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 467 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 474 aa  297  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 474 aa  297  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  36.15 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 		 491 aa  296  5e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  36.09 
 
 		 471 aa  296  5e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 471 aa  296  6e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  37.15 
 
 		 471 aa  296  6e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 		 485 aa  295  9e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 		 467 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 471 aa  295  9e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02306  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000163468  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  39.47 
 
 		 509 aa  295  1e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  34.87 
 
 		 535 aa  295  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  36.94 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  36.94 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>