More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1899 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  72.28 
 
 
494 aa  702    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  99.39 
 
 
490 aa  978    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  83.74 
 
 
491 aa  833    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  99.39 
 
 
490 aa  978    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
490 aa  983    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  85.42 
 
 
495 aa  835    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  67.15 
 
 
493 aa  635    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  77.41 
 
 
490 aa  724    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  74.85 
 
 
504 aa  729    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  64.63 
 
 
509 aa  622  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  66.11 
 
 
496 aa  615  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  64.27 
 
 
501 aa  610  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  65.77 
 
 
501 aa  608  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  63.95 
 
 
512 aa  605  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  65 
 
 
499 aa  607  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1202  glutamyl-tRNA synthetase  64.2 
 
 
503 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461842  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  62.73 
 
 
504 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  61.28 
 
 
505 aa  603  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  61.38 
 
 
509 aa  598  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  61.1 
 
 
532 aa  597  1e-169  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  60.37 
 
 
492 aa  596  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  61.9 
 
 
504 aa  592  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 
491 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0201  glutamate--tRNA ligase  57.23 
 
 
517 aa  565  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1261  glutamyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
506 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08640  glutamyl-tRNA synthetase  62.27 
 
 
525 aa  548  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  55.26 
 
 
494 aa  517  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  45.32 
 
 
504 aa  363  4e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
484 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
487 aa  332  9e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
498 aa  332  1e-89  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
485 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
504 aa  330  3e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  43.89 
 
 
455 aa  329  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 
469 aa  327  3e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
484 aa  326  7e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
490 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 
470 aa  323  4e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 
468 aa  322  8e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 
488 aa  322  9.000000000000001e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
469 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
494 aa  319  9e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 
477 aa  318  1e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 
455 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
500 aa  317  4e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 
469 aa  316  6e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
482 aa  315  8e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
492 aa  314  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  36.44 
 
 
473 aa  312  9e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 
535 aa  310  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  36.99 
 
 
516 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
501 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  36.34 
 
 
479 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  39.06 
 
 
496 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.78 
 
 
485 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  35.1 
 
 
490 aa  306  5.0000000000000004e-82  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.16 
 
 
478 aa  306  6e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  34.1 
 
 
480 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
493 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
506 aa  305  9.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 
491 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  37.5 
 
 
490 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 
469 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  35.51 
 
 
495 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 
488 aa  304  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 
481 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0623  glutamyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
477 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.122003  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  36.38 
 
 
485 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 
481 aa  302  7.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
492 aa  303  7.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 
507 aa  302  9e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
468 aa  301  1e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
505 aa  301  2e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  35.25 
 
 
462 aa  301  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
471 aa  301  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
514 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 
481 aa  300  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
493 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 
493 aa  299  6e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 
493 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 
510 aa  299  7e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  35.43 
 
 
517 aa  299  9e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 
488 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
467 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  37.93 
 
 
495 aa  298  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0456  glutamyl-tRNA synthetase  35 
 
 
466 aa  298  2e-79  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
503 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  37.01 
 
 
469 aa  297  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 
466 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  38.24 
 
 
472 aa  296  5e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8974  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
471 aa  296  6e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135542  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
512 aa  295  9e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 
509 aa  295  9e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 
485 aa  295  1e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
493 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 
500 aa  295  1e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  37.37 
 
 
465 aa  295  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 
471 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  36.51 
 
 
493 aa  293  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  37.14 
 
 
465 aa  293  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>