More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2363 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2363  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 475 aa  969    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.511106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8974  glutamyl-tRNA synthetase  70.97 
 
 		 471 aa  682    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0623  glutamyl-tRNA synthetase  67.23 
 
 		 477 aa  632  1e-180  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.122003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  68.02 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3375  glutamyl-tRNA synthetase  67.81 
 
 		 465 aa  626  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  66.52 
 
 		 455 aa  622  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  66.52 
 
 		 481 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2647  glutamyl-tRNA synthetase  65.74 
 
 		 463 aa  618  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1684  glutamyl-tRNA synthetase  63.56 
 
 		 500 aa  598  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0521087  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3219  glutamyl-tRNA synthetase  67.8 
 
 		 470 aa  589  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00410976  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  65.73 
 
 		 455 aa  587  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  49.24 
 
 		 468 aa  413  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 		 490 aa  356  3.9999999999999996e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 468 aa  342  9e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 479 aa  341  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 468 aa  335  7e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 469 aa  335  1e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 464 aa  334  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 477 aa  333  4e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 466 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.4 
 
 		 466 aa  330  3e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 501 aa  330  4e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 487 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 472 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  40.21 
 
 		 463 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 470 aa  326  7e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 484 aa  322  7e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 491 aa  320  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 482 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 494 aa  320  5e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 484 aa  318  2e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 480 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 465 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  37.78 
 
 		 495 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 495 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 485 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 473 aa  313  4.999999999999999e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  37.82 
 
 		 469 aa  313  4.999999999999999e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  38.36 
 
 		 464 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 467 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  39.87 
 
 		 465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 475 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  38.68 
 
 		 490 aa  308  1.0000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 		 467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 492 aa  306  6e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 472 aa  306  6e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 494 aa  306  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3417  glutamyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 		 469 aa  303  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000634908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 496 aa  302  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  39.29 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 492 aa  301  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 		 474 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 491 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 463 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 504 aa  300  4e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 		 480 aa  300  4e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  40.16 
 
 		 509 aa  300  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  39.5 
 
 		 471 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 468 aa  299  6e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 490 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 490 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  40.17 
 
 		 463 aa  299  7e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 493 aa  299  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 491 aa  299  9e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 532 aa  299  9e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 473 aa  298  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1886  glutamyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 466 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  40.25 
 
 		 490 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1875  glutamyl-tRNA synthetase  34.79 
 
 		 470 aa  298  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 466 aa  298  2e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 476 aa  298  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 467 aa  297  3e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  38.82 
 
 		 475 aa  297  3e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 473 aa  296  7e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 474 aa  295  8e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2812  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 473 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2028  glutamyl-tRNA synthetase  37.03 
 
 		 467 aa  295  8e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 		 496 aa  294  2e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2842  glutamyl-tRNA synthetase  37.79 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0810716  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 474 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 473 aa  294  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04820  glutamyl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 467 aa  294  3e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  37.26 
 
 		 474 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 490 aa  294  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 494 aa  293  5e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>