More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3219 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  70.88 
 
 		 469 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1684  glutamyl-tRNA synthetase  76.32 
 
 		 500 aa  741    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0521087  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3375  glutamyl-tRNA synthetase  70.11 
 
 		 465 aa  648    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3219  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 470 aa  942    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00410976  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2647  glutamyl-tRNA synthetase  66.81 
 
 		 463 aa  630  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8974  glutamyl-tRNA synthetase  66.16 
 
 		 471 aa  617  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2363  glutamyl-tRNA synthetase  67.8 
 
 		 475 aa  608  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.511106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  65.24 
 
 		 455 aa  607  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  66.6 
 
 		 481 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0623  glutamyl-tRNA synthetase  64.48 
 
 		 477 aa  592  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.122003  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  65.88 
 
 		 455 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 468 aa  413  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 490 aa  341  1e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  41.54 
 
 		 468 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 477 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 471 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 479 aa  336  5e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 466 aa  336  7e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 466 aa  336  7e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 472 aa  334  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  39.61 
 
 		 464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 482 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  39.54 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 463 aa  322  8e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 492 aa  320  1.9999999999999998e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.17 
 
 		 491 aa  320  3e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 480 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  41.24 
 
 		 491 aa  317  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 476 aa  317  4e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 501 aa  316  6e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 469 aa  315  7e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 492 aa  315  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 473 aa  315  9.999999999999999e-85  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 487 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 469 aa  314  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 494 aa  312  9e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  34.92 
 
 		 480 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 		 498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 467 aa  310  4e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 493 aa  310  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 485 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 475 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 		 470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 494 aa  307  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 465 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 484 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1105  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 473 aa  306  7e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 475 aa  306  7e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 535 aa  306  8.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 496 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 481 aa  304  2.0000000000000002e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3213  glutamyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.948466  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 465 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 495 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 504 aa  303  4.0000000000000003e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 		 473 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 484 aa  303  6.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 474 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  39.91 
 
 		 490 aa  302  7.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 		 464 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 485 aa  301  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 468 aa  302  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1147  glutamyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 473 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  40.3 
 
 		 474 aa  301  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1959  glutamyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  39.45 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3252  glutamyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 		 473 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 466 aa  300  4e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  37.03 
 
 		 495 aa  300  4e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  40.09 
 
 		 474 aa  300  5e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 492 aa  299  6e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  35.91 
 
 		 488 aa  299  9e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 		 468 aa  299  9e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 467 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 509 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.97 
 
 		 486 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 507 aa  297  3e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 474 aa  296  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1179  glutamyl-tRNA synthetase  38 
 
 		 500 aa  296  6e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000996044  normal  0.265022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.7 
 
 		 500 aa  296  7e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 491 aa  295  8e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1734  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 472 aa  296  8e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.70962  normal  0.372059 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 474 aa  295  9e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 495 aa  295  9e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1709  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 491 aa  295  1e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 532 aa  295  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0944  glutamyl-tRNA synthetase  38.71 
 
 		 472 aa  295  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163057  hitchhiker  0.00772012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2451  glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 474 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.456105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 506 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1202  glutamyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 		 503 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  36.61 
 
 		 469 aa  295  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 471 aa  293  3e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>