More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3375 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3375  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 465 aa  947    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  94.84 
 
 		 469 aa  909    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1684  glutamyl-tRNA synthetase  68.58 
 
 		 500 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0521087  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8025  glutamyl-tRNA synthetase  68.24 
 
 		 455 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2647  glutamyl-tRNA synthetase  70.26 
 
 		 463 aa  655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018952  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0181  glutamyl-tRNA synthetase  68.44 
 
 		 481 aa  635    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0623  glutamyl-tRNA synthetase  68.02 
 
 		 477 aa  618  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.122003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8974  glutamyl-tRNA synthetase  66.74 
 
 		 471 aa  614  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3219  glutamyl-tRNA synthetase  69.68 
 
 		 470 aa  610  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00410976  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2363  glutamyl-tRNA synthetase  67.81 
 
 		 475 aa  609  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.511106  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2805  glutamyl-tRNA synthetase  66.95 
 
 		 455 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.390726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 		 468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  40.46 
 
 		 490 aa  341  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 		 487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 463 aa  333  6e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 472 aa  332  8e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  38.63 
 
 		 464 aa  331  1e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  39.7 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  37.92 
 
 		 491 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 		 484 aa  322  8e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  39.83 
 
 		 468 aa  322  9.000000000000001e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 482 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 494 aa  315  8e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  34.74 
 
 		 480 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0264  glutamyl-tRNA synthetase  39.32 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.530461  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 		 494 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 491 aa  312  7.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 464 aa  312  9e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  39.66 
 
 		 471 aa  310  2.9999999999999997e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 		 492 aa  310  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 477 aa  309  9e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2533  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000148885  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0600  glutamyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 		 476 aa  307  3e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.235091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 501 aa  306  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 465 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  39.41 
 
 		 480 aa  303  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 492 aa  303  6.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2022  glutamyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 475 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.862519 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1645  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 475 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.821622  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  36.33 
 
 		 495 aa  302  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0996  glutamyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 464 aa  300  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.990972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1523  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 474 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316174  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  38.28 
 
 		 468 aa  300  4e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  36.77 
 
 		 480 aa  300  4e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 509 aa  300  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 498 aa  299  7e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  41.09 
 
 		 512 aa  299  8e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 		 466 aa  299  9e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5036  glutamyl-tRNA synthetase  38.59 
 
 		 474 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1892  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 473 aa  298  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0298  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 469 aa  298  2e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  37.32 
 
 		 492 aa  296  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0647  glutamyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 474 aa  296  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1680  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 473 aa  296  6e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.596581 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 504 aa  296  7e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  40.72 
 
 		 501 aa  296  7e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 		 490 aa  295  8e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 485 aa  295  8e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1410  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 473 aa  294  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.999682  normal  0.435226 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 496 aa  294  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 490 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0192  glutamyl-tRNA synthetase  36.62 
 
 		 463 aa  294  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 490 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2739  glutamyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 471 aa  293  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000464093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 471 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.99689e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1437  glutamyl-tRNA synthetase  36.05 
 
 		 471 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.000000000838412  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 490 aa  293  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 		 504 aa  293  6e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1191  glutamyl-tRNA synthetase  36.27 
 
 		 471 aa  292  7e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0302622  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.67 
 
 		 478 aa  292  8e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  36.42 
 
 		 467 aa  292  8e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 501 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1601  glutamyl-tRNA synthetase  39.15 
 
 		 468 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5223  glutamyl-tRNA synthetase  37.39 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.142944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 504 aa  291  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5146  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.883623  normal  0.0418942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2919  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 469 aa  290  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000159151  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4681  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 474 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4369  glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 471 aa  290  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 471 aa  290  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 		 471 aa  290  4e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1055  glutamyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 		 471 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.291926  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1449  glutamyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 		 469 aa  289  6e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000565413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1844  glutamyl-tRNA synthetase  36.19 
 
 		 496 aa  289  6e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.339002  normal  0.308571 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2043  glutamyl-tRNA synthetase  37.66 
 
 		 473 aa  289  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3084  glutamyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 		 471 aa  289  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00745356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 471 aa  289  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 		 485 aa  289  8e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  37.95 
 
 		 496 aa  288  1e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  36.7 
 
 		 471 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>