More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2263 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2263  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
504 aa  1022    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000271542 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18620  glutamyl-tRNA synthetase  65.67 
 
 
509 aa  686    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.255586  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11010  glutamyl-tRNA synthetase  70.18 
 
 
509 aa  716    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1565  glutamyl-tRNA synthetase  65.9 
 
 
499 aa  658    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1688  glutamyl-tRNA synthetase  69.43 
 
 
505 aa  694    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685546 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1261  glutamyl-tRNA synthetase  63.6 
 
 
506 aa  651    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0201  glutamate--tRNA ligase  63.39 
 
 
517 aa  651    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08640  glutamyl-tRNA synthetase  74 
 
 
525 aa  723    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2526  glutamyl-tRNA synthetase  80.56 
 
 
504 aa  806    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0325901  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09010  glutamyl-tRNA synthetase  66.53 
 
 
493 aa  637    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.683612  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1202  glutamyl-tRNA synthetase  68.54 
 
 
503 aa  684    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.461842  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1356  glutamyl-tRNA synthetase  65.38 
 
 
501 aa  664    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556495  normal  0.576333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6009  glutamyl-tRNA synthetase  65.24 
 
 
496 aa  625  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4059  glutamyl-tRNA synthetase  63.92 
 
 
501 aa  622  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.93103  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4229  glutamyl-tRNA synthetase  64.6 
 
 
491 aa  620  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2851  glutamyl-tRNA synthetase  61.41 
 
 
504 aa  617  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  62.7 
 
 
490 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  62.7 
 
 
490 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1970  glutamyl-tRNA synthetase  59.26 
 
 
492 aa  608  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10720  glutamyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 
532 aa  609  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0971549  normal  0.479795 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2133  glutamyl-tRNA synthetase  63.19 
 
 
495 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  63.09 
 
 
490 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3218  glutamyl-tRNA synthetase  61.27 
 
 
494 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.464884  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1475  glutamyl-tRNA synthetase  60.94 
 
 
512 aa  591  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.472401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13007  glutamyl-tRNA synthetase  62.78 
 
 
490 aa  588  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000196997  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3336  glutamyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 
491 aa  568  1e-161  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00658512  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1338  glutamyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 
494 aa  539  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
504 aa  372  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
506 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
482 aa  347  4e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.68 
 
 
485 aa  343  4e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 
477 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  40.36 
 
 
507 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  38.11 
 
 
490 aa  332  8e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
494 aa  331  2e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  39.03 
 
 
485 aa  330  3e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 
491 aa  329  8e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
500 aa  329  8e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  38.3 
 
 
491 aa  329  9e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
495 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 
498 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
486 aa  326  7e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  38.04 
 
 
496 aa  325  8.000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 
485 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
469 aa  325  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 
488 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 
469 aa  322  8e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
469 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
491 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  37.63 
 
 
505 aa  320  3e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 
503 aa  320  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
473 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
484 aa  320  5e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
485 aa  319  6e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
485 aa  319  6e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
485 aa  319  6e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
485 aa  319  6e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
485 aa  319  6e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
485 aa  319  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 
491 aa  319  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  38.93 
 
 
488 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 
501 aa  318  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  38.48 
 
 
484 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 
485 aa  316  5e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  35.05 
 
 
479 aa  316  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 
491 aa  316  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.48 
 
 
490 aa  316  6e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 
509 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 
487 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1528  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 
468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 
492 aa  315  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  34.3 
 
 
488 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  36.76 
 
 
535 aa  313  5.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.33 
 
 
504 aa  310  2.9999999999999997e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  37.55 
 
 
492 aa  310  4e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  37.76 
 
 
485 aa  309  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  37.42 
 
 
488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  36.14 
 
 
484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  36.83 
 
 
509 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
468 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
484 aa  306  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 
506 aa  306  5.0000000000000004e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  36.91 
 
 
484 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  35.99 
 
 
514 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
463 aa  301  1e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1176  glutamyl-tRNA synthetase  35.61 
 
 
462 aa  301  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  37.24 
 
 
467 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  36.46 
 
 
493 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  38.35 
 
 
466 aa  300  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
484 aa  300  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
484 aa  300  5e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  34.57 
 
 
490 aa  300  5e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  36.8 
 
 
464 aa  299  6e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 
493 aa  299  9e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
488 aa  298  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
478 aa  297  3e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3615  glutamyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
469 aa  296  5e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.741076  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  35.83 
 
 
464 aa  296  9e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  34.37 
 
 
495 aa  295  9e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  35.67 
 
 
494 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>