More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4662 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 489 aa  999    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 		 509 aa  489  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  52.01 
 
 		 505 aa  490  1e-137  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 		 493 aa  488  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 509 aa  484  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  49.89 
 
 		 493 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 		 514 aa  479  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  49.68 
 
 		 494 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 493 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 493 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 493 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  49.36 
 
 		 493 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  49.15 
 
 		 493 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  49.47 
 
 		 494 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  50.21 
 
 		 493 aa  472  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 493 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 504 aa  466  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 		 494 aa  466  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 		 493 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 492 aa  458  1e-127  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  47.8 
 
 		 503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  48.76 
 
 		 506 aa  448  1e-125  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 485 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 484 aa  448  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  49.79 
 
 		 476 aa  436  1e-121  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  50.1 
 
 		 504 aa  435  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 488 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 484 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  50.42 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 480 aa  404  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 492 aa  404  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 484 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 487 aa  395  1e-109  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 484 aa  383  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 		 480 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 507 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 506 aa  368  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 		 494 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  41.15 
 
 		 495 aa  368  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 506 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 503 aa  364  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  38.38 
 
 		 490 aa  360  3e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 477 aa  360  4e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 501 aa  360  5e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 495 aa  356  5e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 		 490 aa  353  5e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0757  glutamyl-tRNA synthetase  39.79 
 
 		 495 aa  352  5.9999999999999994e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.22567  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 488 aa  349  6e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 482 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 493 aa  347  3e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  41.25 
 
 		 496 aa  347  3e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  37.84 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 516 aa  346  7e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  39.36 
 
 		 501 aa  343  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 502 aa  343  5e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  39.04 
 
 		 502 aa  343  5.999999999999999e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.17 
 
 		 485 aa  342  7e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 498 aa  342  9e-93  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 490 aa  340  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 		 491 aa  340  4e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 504 aa  340  4e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  37.81 
 
 		 491 aa  340  4e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 512 aa  339  7e-92  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  38.54 
 
 		 502 aa  338  9e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  38.13 
 
 		 494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  38.23 
 
 		 503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 502 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.4 
 
 		 488 aa  333  5e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0944  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 464 aa  331  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000402314  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 		 503 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.25 
 
 		 485 aa  330  4e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 479 aa  329  8e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 463 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 517 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0922  glutamyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 		 464 aa  327  3e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000416745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 488 aa  326  5e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 		 490 aa  326  6e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 465 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  36.55 
 
 		 500 aa  325  1e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3180  glutamyl-tRNA synthetase  39.88 
 
 		 490 aa  325  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2552  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 471 aa  324  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000112104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3632  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 471 aa  323  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000908657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 485 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 509 aa  323  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.27 
 
 		 466 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2779  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 471 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00021769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1302  glutamyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 		 535 aa  323  6e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2779  glutamyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 471 aa  322  7e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000172763  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  38.14 
 
 		 480 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.527143 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1259  glutamyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000107097  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2558  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000165684  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1272  glutamyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000352174  hitchhiker  0.00569831 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2689  glutamyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000585345  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2607  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00191122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02267  hypothetical protein  38.72 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000211719  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2673  glutamyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0521229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2537  glutamyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 471 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.81823e-19  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>